RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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HDGFL3-201ENST00000299633 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.33□□□□□ -1.24
HDGFL3-201ENST00000299633 H3BNG1 76 aa7.32□□□□□ -1.24
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HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PNN7 141 aa7.32□□□□□ -1.24
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.31□□□□□ -1.24
HDGFL3-201ENST00000299633 OCR1Q9BZK8 76 aa7.31□□□□□ -1.24
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HDGFL3-201ENST00000299633 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.31□□□□□ -1.24
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HDGFL3-201ENST00000299633 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.29□□□□□ -1.24
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HDGFL3-201ENST00000299633 FRYQ5TBA9 3013 aa7.28□□□□□ -1.24
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HDGFL3-201ENST00000299633 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.25□□□□□ -1.25
HDGFL3-201ENST00000299633 FLNCQ14315 2725 aa7.24□□□□□ -1.25
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HDGFL3-201ENST00000299633 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.2□□□□□ -1.26
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HDGFL3-201ENST00000299633 TACC2O95359 2948 aa7.18□□□□□ -1.26
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HDGFL3-201ENST00000299633 COL12A1Q99715 3063 aa7.15□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 M0R2T5 61 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDGFL3-201ENST00000299633 NF1P21359 2839 aa7.13□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 SPRR4Q96PI1 79 aa7.13□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 PDZD2O15018 2839 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDGFL3-201ENST00000299633 BRCA2P51587 3418 aa7.12□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 ZZEF1O43149 2961 aa7.11□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.11□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.11□□□□□ -1.27
HDGFL3-201ENST00000299633 TNP2Q05952 138 aa7.1□□□□□ -1.27
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HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PNM2 257 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDGFL3-201ENST00000299633 TENM3Q9P273 2699 aa7.03□□□□□ -1.28
HDGFL3-201ENST00000299633 PRR34Q9NV39 138 aa7.03□□□□□ -1.28
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP10-11P60412 298 aa7.01□□□□□ -1.29
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7□□□□□ -1.29
HDGFL3-201ENST00000299633 LAMA1P25391 3075 aa7□□□□□ -1.29
HDGFL3-201ENST00000299633 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7□□□□□ -1.29
HDGFL3-201ENST00000299633 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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HDGFL3-201ENST00000299633 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.97□□□□□ -1.29
HDGFL3-201ENST00000299633 Q5W150 140 aa6.97□□□□□ -1.29
HDGFL3-201ENST00000299633 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.96□□□□□ -1.3
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HDGFL3-201ENST00000299633 M0QZ58 72 aa6.94□□□□□ -1.3
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HDGFL3-201ENST00000299633 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.9□□□□□ -1.3
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP10-3P60369 221 aa6.9□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 Q8NDZ9 215 aa6.89□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.89□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 CASC10Q5T4H9 136 aa6.88□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 K7EIL1 84 aa6.88□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.87□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.86□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 A6NN06 94 aa6.84□□□□□ -1.31
HDGFL3-201ENST00000299633 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.83□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 ZFHX3Q15911 3703 aa6.82□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 TGP01266 2768 aa6.81□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 ATMQ13315 3056 aa6.8□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 AKAP9Q99996 3911 aa6.8□□□□□ -1.32
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