RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PMCHL1Q16048 86 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MT2AP02795 61 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 H0Y8G0 127 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QQQ9 107 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 YPEL4Q96NS1 127 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXCQ9NY87 97 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF815PA8K554 130 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB1A1P11684 91 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PLNP26678 52 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 NPC2P61916 151 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 Q96NJ1 140 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GWB2 263 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 A4D1N5 150 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1FP04733 61 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MTURNQ8N3F0 131 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HSBP1O75506 76 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6JHZ5 121 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 LST1O00453 97 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2V1Q13404 147 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFL1Q6UW32 110 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS9Q8WXC6 57 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0J9YXY3 114 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BKO60814 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 DPM2O94777 84 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BJP06899 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BOP23527 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BBP33778 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BDP58876 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BCP62807 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GV72 72 aa3.93□□□□□ -1.78
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PGGT1B-201ENST00000296642 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JQZ4 141 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 K7ERU9 68 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 LEPROTL1O95214 131 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKCP01834 107 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 PET117Q6UWS5 81 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS25Q9BRG1 176 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MUU9 505 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM17BO60830 172 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP4P15090 132 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZVH6 145 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NDN8 102 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB1D1O95968 90 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-201ENST00000296642 VAMP3Q15836 100 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.9□□□□□ -1.79
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PGGT1B-201ENST00000296642 LITAFQ99732 161 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-201ENST00000296642 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-201ENST00000296642 hADV29S1A0JD25 119 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZQY7 126 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SNCGO76070 127 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 HRES1P13985 223 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00313P59037 77 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 NEBP20929 6669 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 DSCR10P59022 87 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TEN1Q86WV5 123 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGMAR1Q99720 223 aa3.81□□□□□ -1.8
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