RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LUZP6Q538Z0 58 aa12.85□□□□□ -0.35
CCSAP-201ENST00000284617 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 Q5VV11 94 aa12.83□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf42Q9H799 3197 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 DMAC1Q96GE9 116 aa12.81□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa12.78□□□□□ -0.36
CCSAP-201ENST00000284617 CSAG1Q6PB30 78 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TEX15Q9BXT5 2789 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-201ENST00000284617 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK7P58062 85 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 UNC79Q9P2D8 2635 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 S4R3F8 94 aa12.69□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF292O60281 2723 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 PCNTO95613 3336 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00483Q53H64 154 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP54Q96N23 3096 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 PRAC1Q96KF2 57 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-201ENST00000284617 MGAQ8IWI9 3026 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-201ENST00000284617 OXTP01178 125 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-201ENST00000284617 NOTCH1P46531 2555 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-201ENST00000284617 HTTP42858 3142 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-201ENST00000284617 COL6A5A8TX70 2615 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZR54 194 aa12.58□□□□□ -0.4
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-201ENST00000284617 TRANK1O15050 2925 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0C4DFX4 3053 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-1P60331 282 aa12.5□□□□□ -0.41
CCSAP-201ENST00000284617 R4GN34 69 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-201ENST00000284617 M0R2T5 61 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-201ENST00000284617 RPL37P61927 97 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-2P60368 255 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-201ENST00000284617 PANO1I0J062 215 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-201ENST00000284617 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-201ENST00000284617 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-201ENST00000284617 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ROMO1P60602 79 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-201ENST00000284617 Q5VSD8 79 aa12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa12.36□□□□□ -0.43
CCSAP-201ENST00000284617 LCE6AA0A183 80 aa12.36□□□□□ -0.43
CCSAP-201ENST00000284617 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-201ENST00000284617 WDFY4Q6ZS81 3184 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-201ENST00000284617 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087X002 238 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-201ENST00000284617 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-201ENST00000284617 H3BS24 57 aa12.27□□□□□ -0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.26□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A0MQY5 61 aa12.26□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 M0QZ58 72 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA8Q6RVD6 105 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-201ENST00000284617 LAMA3Q16787 3333 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RPS29P62273 56 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-201ENST00000284617 FRYQ5TBA9 3013 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-201ENST00000284617 BRCA2P51587 3418 aa12.09□□□□□ -0.47
CCSAP-201ENST00000284617 BAHCC1Q9P281 2608 aa12.08□□□□□ -0.48
CCSAP-201ENST00000284617 TRIOO75962 3097 aa12.07□□□□□ -0.48
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12.04□□□□□ -0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ITPR1Q14643 2758 aa12.03□□□□□ -0.48
CCSAP-201ENST00000284617 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa12.03□□□□□ -0.48
CCSAP-201ENST00000284617 ITPR2Q14571 2701 aa12.03□□□□□ -0.48
CCSAP-201ENST00000284617 A6NN06 94 aa12□□□□□ -0.49
CCSAP-201ENST00000284617 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.99□□□□□ -0.49
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.93□□□□□ -0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PLAC4Q8WY50 150 aa11.92□□□□□ -0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa11.87□□□□□ -0.51
CCSAP-201ENST00000284617 FLNCQ14315 2725 aa11.86□□□□□ -0.51
CCSAP-201ENST00000284617 A8MU10 97 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-201ENST00000284617 KALRNO60229 2985 aa11.84□□□□□ -0.51
CCSAP-201ENST00000284617 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.83□□□□□ -0.52
CCSAP-201ENST00000284617 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.82□□□□□ -0.52
CCSAP-201ENST00000284617 TACC2O95359 2948 aa11.8□□□□□ -0.52
CCSAP-201ENST00000284617 A8MUU9 505 aa11.78□□□□□ -0.52
CCSAP-201ENST00000284617 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-201ENST00000284617 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CCSAP-201ENST00000284617 APCP25054 2843 aa11.74□□□□□ -0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CDH23Q9H251 3354 aa11.72□□□□□ -0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ATMQ13315 3056 aa11.72□□□□□ -0.53
CCSAP-201ENST00000284617 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.68□□□□□ -0.54
CCSAP-201ENST00000284617 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa11.68□□□□□ -0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HIVEP1P15822 2718 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-201ENST00000284617 COL12A1Q99715 3063 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 703.6 ms