RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 ESRGQ1W209 222 aa8.88□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 H3BQ85 93 aa8.87□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 V9GYY9 64 aa8.86□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.86□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.86□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A0J9YWU9 116 aa8.85□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.85□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 BCE1O60756 84 aa8.84□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 MAST4O15021 2626 aa8.84□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CYFIP1-211ENST00000619348 COL6A5A8TX70 2615 aa8.83□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.83□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 IGKV4-1P06312 121 aa8.82□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 RETNQ9HD89 108 aa8.82□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A0G2JQZ4 141 aa8.82□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A1W2PNN7 141 aa8.82□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 VPREB1P12018 145 aa8.81□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 SYCNQ0VAF6 134 aa8.81□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 C1orf137Q5JT78 98 aa8.81□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.8□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.8□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A096LNI7 61 aa8.8□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.79□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 Q6ZRP5 223 aa8.78□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.78□□□□□ -1
CYFIP1-211ENST00000619348 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.76□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.76□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 C7orf33Q8WU49 177 aa8.76□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.76□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 C16orf95Q9H693 158 aa8.76□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.76□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.75□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 Q6ZTC4 211 aa8.75□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 EPM2AB3EWF7 344 aa8.75□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 OCR1Q9BZK8 76 aa8.75□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 AKAP9Q99996 3911 aa8.75□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 STAB1Q9NY15 2570 aa8.75□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.74□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.74□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 Q8N377 158 aa8.74□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 LINC00208Q96KT6 92 aa8.74□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 MP68P56378 58 aa8.74□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 FAM168BA1KXE4 195 aa8.73□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 K7EQZ3 153 aa8.73□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.73□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 SEC61GP60059 68 aa8.72□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 Q8NAQ8 132 aa8.72□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 PRR34Q9NV39 138 aa8.72□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 KRTAP10-3P60369 221 aa8.72□□□□□ -1.01
CYFIP1-211ENST00000619348 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.7□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.7□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A087WSZ3 146 aa8.69□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A1W2PNM2 257 aa8.69□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 C15orf56Q8N910 161 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 INAFM1C9JVW0 142 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 A8MUN3 132 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PMAIP1Q13794 54 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 ERC2-IT1O76042 136 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PSCAO43653 123 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 PRLHP81277 87 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 HCG22E2RYF7 251 aa8.65□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 Q8NBF4 154 aa8.65□□□□□ -1.02
CYFIP1-211ENST00000619348 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 H0Y9J4 135 aa8.65□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TENM3Q9P273 2699 aa8.64□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 Q6ZRX8 168 aa8.64□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 hDV103S1A0JD37 113 aa8.63□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.62□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 PRR15LQ9BU68 103 aa8.61□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.61□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.61□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 Q9BRP9 147 aa8.61□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 NDUFS5O43920 106 aa8.6□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.6□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 UBE2AP49459 152 aa8.6□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 DSCR10P59022 87 aa8.59□□□□□ -1.03
CYFIP1-211ENST00000619348 A6NED7 52 aa8.59□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 PCOTHQ58A44 107 aa8.58□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 CASC10Q5T4H9 136 aa8.58□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 H0Y9P7 68 aa8.57□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.57□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 B9D2Q9BPU9 175 aa8.57□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 NDUFB1O75438 58 aa8.57□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.57□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 REG3GQ6UW15 175 aa8.56□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 CASC2Q6XLA1 102 aa8.56□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 F8WDY8 70 aa8.55□□□□□ -1.04
CYFIP1-211ENST00000619348 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms