RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 H3BRM9 83 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 ATP5LO75964 103 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 SPRR1AP35321 89 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 COX17Q14061 63 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 BAGE3Q86Y29 109 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 APOC3P02656 99 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SMIM13P0DJ93 91 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 NDUFA6P56556 154 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SPRR4Q96PI1 79 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 A0A0U1RRA0 63 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 UBE2AP49459 152 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 ERC2-IT1O76042 136 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SNAPINO95295 136 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 TPRXLQ17RH7 258 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 ARL17AQ8IVW1 177 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 NCR3O14931 201 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 TRGC2P03986 189 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 LINC00158P58513 81 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 LINC00483Q53H64 154 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SVBPQ8N300 66 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 Q9BRP9 147 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 COLCA2A8K830 154 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SERF1AO75920 110 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 CTAG1AP78358 180 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SFTA2Q6UW10 78 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 DAND5Q8N907 189 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 LEPROTO15243 131 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-212ENST00000597259 HSBP1O75506 76 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 IGLV6-57P01721 117 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HERV-K104P63124 156 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZVQ6 151 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 H0Y8G0 127 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 J3QQQ9 107 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 LEPROTL1O95214 131 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 OCR1Q9BZK8 76 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 A0A0J9YXY3 114 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 NDUFC2O95298 119 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 FABP4P15090 132 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 NDUFA5Q16718 116 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZRX8 168 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 C5orf52A6NGY3 159 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 E9PLD3 99 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 DPM2O94777 84 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 IGKCP01834 107 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 PLNP26678 52 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 DDTP30046 118 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BKO60814 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 SPINK1P00995 79 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BJP06899 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 SPRR1BP22528 89 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BOP23527 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BBP33778 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 NMUP48645 174 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BDP58876 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 NPC2P61916 151 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BCP62807 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 MOBPQ13875 183 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms