RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-230	ENST00000590638		H3BUT2	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-230	ENST00000590638	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-230	ENST00000590638	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-230	ENST00000590638	LCE6A	A0A183	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	WFDC2	Q14508	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	TSPAN13	O95857	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	FABP2	P12104	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	HERC2	O95714	4834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A1W2PPM0	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638		H7C2G1	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	VAMP3	Q15836	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A087WTM6	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	COX6C	P09669	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	PSMB2	P49721	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638		Q8N814	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	LYST	Q99698	3801 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638		M0R378	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		K7EP34	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	NCR3	O14931	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	PRR4	Q16378	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		Q8NDZ9	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A096LNI7	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		H0YGX0	51 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	RTL8C	O15255	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	TCL1B	O95988	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	RYR1	P21817	5038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		H3BMG7	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	LST1	O00453	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A1B0GX51	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A1W2PNN7	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638		F8W1H4	67 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	SNCG	O76070	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638		M0QXV9	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRAC	P01848	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638		C9JAW5	83 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	SLC25A20	O43772	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-230	ENST00000590638	DNAL4	O96015	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms