RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 A0A1B0GWB2 263 aa10.5□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 Q8N1X5 172 aa10.5□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 K7ERJ3 54 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 C1orf137Q5JT78 98 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 Q5VSD8 79 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 RAB37Q96AX2 223 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 HERC2O95714 4834 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 FAM229AH3BQW9 127 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 BCE1O60756 84 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 SMIM11BQ8TCY0 68 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 PRO1854Q9UHT4 67 aa10.46□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.46□□□□□ -0.73
ITGAE-202ENST00000570360 IGLV7-43P04211 117 aa10.45□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.45□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 H7C2G1 150 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 C6orf99Q4VX62 202 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 DIRC1Q969H9 104 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 PRLHP81277 87 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.42□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 B5MCH6 92 aa10.42□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 BATFQ16520 125 aa10.42□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 UBE2AP49459 152 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 Q6ZRX8 168 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGAE-202ENST00000570360 H0Y9J4 135 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 TSPAN13O95857 204 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.38□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF861PO60384 105 aa10.38□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 Q1RN00 199 aa10.38□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.38□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 COX7BP24311 80 aa10.37□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 Q9BRP9 147 aa10.37□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 TRIAP1O43715 76 aa10.35□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.35□□□□□ -0.75
ITGAE-202ENST00000570360 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.33□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.33□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 ERC2-IT1O76042 136 aa10.31□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 VAMP3Q15836 100 aa10.31□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 PSMB2P49721 201 aa10.3□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 TAX1BP3O14907 124 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 LINC00575Q6W349 94 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.28□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 FAM218AQ96MZ4 157 aa10.28□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.27□□□□□ -0.76
ITGAE-202ENST00000570360 H0YGX0 51 aa10.27□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 CLEC2BQ92478 149 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 C9orf118A6NHY6 69 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 H3BUT2 72 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR4Q96PI1 79 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 hADV29S1A0JD25 119 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 COX6CP09669 75 aa10.23□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 SLC25A20O43772 301 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
ITGAE-202ENST00000570360 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 A0A1B0GX51 115 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 Q6ZQY7 126 aa10.19□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 A0A1W2PPM0 123 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 LST1O00453 97 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 LINC00483Q53H64 154 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 TCL1BO95988 128 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 SPRR1BP22528 89 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGAE-202ENST00000570360 TRACP01848 142 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 A0A087X002 238 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 SNCGO76070 127 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 Q8N377 158 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 FABP2P12104 132 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 LINC01600Q96MT4 127 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 ATXN8Q156A1 80 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 MYCBP2O75592 4640 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGAE-202ENST00000570360 DNAL4O96015 105 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.8 ms