RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 KRTDAPP60985 99 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 HSD52Q0P140 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 C4AP0C0L4 1744 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 C4BP0C0L5 1744 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.78□□□□□ -2.53
FAM227B-211ENST00000560557 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.78□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CUX1P39880 1505 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM218A2RU14 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SVBPQ8N300 66 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 RGPD5Q99666 1765 aa-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 C5P01031 1676 aa-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 K7EP13 123 aa-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SNAPC5O75971 98 aa-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 PRLHP81277 87 aa-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 PMCHL1Q16048 86 aa-0.8□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 C3orf79P0CE67 100 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 ASIPP42127 132 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MT1XP80297 61 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.81□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 H3BQ15 152 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFC1O43677 76 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 UQCRHP07919 91 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 COX7BP24311 80 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 PRO3102Q9H379 93 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.82□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 ABCC2Q92887 1545 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CUL7Q14999 1698 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 D6R8Y8 96 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00158P58513 81 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.83□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MYOM2P54296 1465 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 LEPROTL1O95214 131 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 MPC2O95563 127 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 HMGN3Q15651 99 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 TSC22D3Q99576 134 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CHD1O14646 1710 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.84□□□□□ -2.54
FAM227B-211ENST00000560557 PPP3R1P63098 170 aa-0.85□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-0.85□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.85□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.85□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.85□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 TRGV9Q99603 122 aa-0.85□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA3Q99758 1704 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 PLXNC1O60486 1568 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 ATMQ13315 3056 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 GNG4P50150 75 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.86□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.87□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.87□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.87□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 GNGT2O14610 69 aa-0.87□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA2O43678 99 aa-0.87□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.87□□□□□ -2.55
FAM227B-211ENST00000560557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms