RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 F8W1H4 67 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 COX6CP09669 75 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 PFN2P35080 140 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZRP5 223 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 DAND5Q8N907 189 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 PRR4Q16378 134 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 CARD19Q96LW7 228 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0U1RRA0 63 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 K7ERJ3 54 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 SLPIP03973 132 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 PSMB2P49721 201 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 Q1RN00 199 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 J3QR89 54 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN13O95857 204 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2D-28P01615 120 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 NPC2P61916 151 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 SNCGO76070 127 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 VPS25Q9BRG1 176 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 A0A096LNI7 61 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 H3BMG7 143 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM126AQ9H061 195 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 M0QXV9 152 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 VPREB1P12018 145 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 ATXN8Q156A1 80 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV6-57P01721 117 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 Q8NDZ9 215 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 PRO0461Q9UI25 63 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 M0R378 163 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE2EQ4V326 116 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 DIRC1Q969H9 104 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-215ENST00000560424 H7C2G1 150 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 TRIAP1O43715 76 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf137Q5JT78 98 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 TCL1BO95988 128 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 H0YGX0 51 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE2BQ13066 116 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 ETDBQ3ZM63 59 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GX51 115 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 NCR3O14931 201 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 PCP4P48539 62 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 LST1O00453 97 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 TEN1Q86WV5 123 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 H0Y9J4 135 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A20O43772 301 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 GHRHP01286 108 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 C22orf24Q9Y442 160 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 TRACP01848 142 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV7-43P04211 117 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB1A1P11684 91 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 SPRR1AP35321 89 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 SIGMAR1Q99720 223 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PNN7 141 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 FAM168BA1KXE4 195 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 C9JAW5 83 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 H3BQ85 93 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-215ENST00000560424 H3BT86 120 aa5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms