RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 Q6JHZ5 121 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 FAM168BA1KXE4 195 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 TEN1Q86WV5 123 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP1-210ENST00000552189 WFDC2Q14508 124 aa5.24□□□□□ -1.57
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SENP1-210ENST00000552189 DMDP11532 3685 aa5.24□□□□□ -1.57
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SENP1-210ENST00000552189 Q5VSD8 79 aa5.08□□□□□ -1.6
SENP1-210ENST00000552189 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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SENP1-210ENST00000552189 ATOX1O00244 68 aa5.05□□□□□ -1.6
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SENP1-210ENST00000552189 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.05□□□□□ -1.6
SENP1-210ENST00000552189 IGKV2-30P06310 120 aa5.05□□□□□ -1.6
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SENP1-210ENST00000552189 Q96NJ1 140 aa5.04□□□□□ -1.6
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SENP1-210ENST00000552189 TGP01266 2768 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP1-210ENST00000552189 C9orf92A6NGG3 77 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP1-210ENST00000552189 LINC00313P59037 77 aa5.03□□□□□ -1.6
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SENP1-210ENST00000552189 Q8N9L7 120 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP1-210ENST00000552189 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP1-210ENST00000552189 TMEM258P61165 79 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP1-210ENST00000552189 LITAFQ99732 161 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP1-210ENST00000552189 SPRR4Q96PI1 79 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP1-210ENST00000552189 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP1-210ENST00000552189 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.01□□□□□ -1.61
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