RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	OXT	P01178	125 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097		Q8NDZ9	215 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CCR3-208	ENST00000545097	LRP2	P98164	4655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097		F8WDY8	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097		J3QQQ9	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	LEPROT	O15243	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097		M0QXV9	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	TSPAN13	O95857	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	PRSS2	P07478	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097		A4D1N5	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	CKS1B	P61024	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	LPA	P08519	4548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097		J3QR89	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	CFC1	P0CG37	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	PSMB2	P49721	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	TRIAP1	O43715	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	TCL1B	O95988	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	PFN2	P35080	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0J9YXY3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	CXCL5	P42830	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0B4J2C4	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0U1RRA0	63 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	UBE2B	P63146	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	VPREB1	P12018	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	LITAF	Q99732	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		H0Y9J4	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		H7C2G1	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		C9JAW5	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097		Q1RN00	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	PRY	O14603	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	SLC25A20	O43772	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	TIMM17B	O60830	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	DAND5	Q8N907	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCR3-208	ENST00000545097	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097		A0A087X002	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF861P	O60384	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	BCE1	O60756	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	IFITM1	P13164	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00158	P58513	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	NPC2	P61916	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097		M0R378	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	PRLH	P81277	87 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0A0MQY5	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	NCR3	O14931	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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