RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 A0A096LNJ9 63 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 ERG28Q9UKR5 140 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2AP49459 152 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 HERVK_113P61574 105 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 COMMD7Q86VX2 200 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 A0A0U1RQV1 116 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP5-9P26371 169 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 PFN2P35080 140 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFA6P56556 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 BAGE3Q86Y29 109 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM126AQ9H061 195 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 LPAP08519 4548 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 C11orf86A6NJI1 115 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00587B1AMM8 73 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV2D-28P01615 120 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFA5Q16718 116 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 M0R378 163 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TSPAN13O95857 204 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 SVBPQ8N300 66 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 MUC2Q02817 5179 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM223A0PJW6 202 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 SCO1O75880 301 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 APOC3P02656 99 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TPRXLQ17RH7 258 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM238C9JI98 176 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00158P58513 81 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 PRLHP81277 87 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 PMCHL1Q16048 86 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 Q8NDZ9 215 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-225ENST00000515835 HSBP1O75506 76 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SPRR1AP35321 89 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 YPEL4Q96NS1 127 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 S100A12P80511 92 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SPRR4Q96PI1 79 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SPINK1P00995 79 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SMIM13P0DJ93 91 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 PLNP26678 52 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 NMUP48645 174 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 LEPROTL1O95214 131 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00483Q53H64 154 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 LEPROTO15243 131 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFC2O95298 119 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 J3QQQ9 107 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 NCR3O14931 201 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 DPM2O94777 84 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 TRGC2P03986 189 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 DDTP30046 118 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZRX8 168 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-225ENST00000515835 H0Y8G0 127 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV6-57P01721 117 aa3.33□□□□□ -1.88
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