RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491761.1

SNED1-211, Transcript of sushi, nidogen and EGF like domains 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNED1, Length 4,125 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1-211ENST00000491761 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.41□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.41□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.41□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 CRYGAP11844 174 aa7.4□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 Q6ZTC4 211 aa7.4□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.4□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.4□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 COX17Q14061 63 aa7.4□□□□□ -1.22
SNED1-211ENST00000491761 KRTAP10-3P60369 221 aa7.39□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 APCP25054 2843 aa7.39□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.38□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 NDUFC1O43677 76 aa7.38□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 C1orf137Q5JT78 98 aa7.37□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.37□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 PMAIP1Q13794 54 aa7.36□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.36□□□□□ -1.23
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SNED1-211ENST00000491761 MUC7Q8TAX7 377 aa7.36□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.36□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 TENM4Q6N022 2769 aa7.35□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.35□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 PCOTHQ58A44 107 aa7.34□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 PRYO14603 147 aa7.34□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 C10orf25Q5T742 122 aa7.34□□□□□ -1.23
SNED1-211ENST00000491761 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.33□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 A0A087WSZ3 146 aa7.33□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 NF1P21359 2839 aa7.32□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 Q6ZRU5 148 aa7.31□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 PRR15LQ9BU68 103 aa7.31□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 KIAA0087Q14695 138 aa7.31□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 Q8NAQ8 132 aa7.3□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.3□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.3□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 MDFIQ99750 246 aa7.3□□□□□ -1.24
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SNED1-211ENST00000491761 F8WDY8 70 aa7.29□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 PRLHP81277 87 aa7.29□□□□□ -1.24
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SNED1-211ENST00000491761 CASC2Q6XLA1 102 aa7.28□□□□□ -1.24
SNED1-211ENST00000491761 SMIM29Q86T20 159 aa7.27□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.27□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 C22orf24Q9Y442 160 aa7.26□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 VPREB1P12018 145 aa7.25□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 HIVEP1P15822 2718 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNED1-211ENST00000491761 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.24□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.23□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 C7orf33Q8WU49 177 aa7.23□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 PRR34Q9NV39 138 aa7.23□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.23□□□□□ -1.25
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SNED1-211ENST00000491761 REG3GQ6UW15 175 aa7.22□□□□□ -1.25
SNED1-211ENST00000491761 LINC00167Q96N53 147 aa7.22□□□□□ -1.25
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SNED1-211ENST00000491761 H0Y9P7 68 aa7.2□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 Q6ZQT0 140 aa7.2□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 Q9BRP9 147 aa7.2□□□□□ -1.26
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SNED1-211ENST00000491761 IGLV6-57P01721 117 aa7.19□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.19□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 SPINK1P00995 79 aa7.18□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.18□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.18□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 CXCL6P80162 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.17□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 HCG22E2RYF7 251 aa7.17□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 A0A0G2JQZ4 141 aa7.16□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 A0A1W2PNN7 141 aa7.16□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.16□□□□□ -1.26
SNED1-211ENST00000491761 Q8NDZ9 215 aa7.16□□□□□ -1.26
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SNED1-211ENST00000491761 PDZD2O15018 2839 aa7.14□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 WIPF1O43516 503 aa7.14□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.14□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.14□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.12□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 K7EIL1 84 aa7.12□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.12□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 KRTAP10-11P60412 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.11□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 H7BZZ5 65 aa7.09□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 C15orf56Q8N910 161 aa7.09□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 FAM168BA1KXE4 195 aa7.09□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 A8MUN3 132 aa7.09□□□□□ -1.27
SNED1-211ENST00000491761 Q6ZRP5 223 aa7.08□□□□□ -1.28
SNED1-211ENST00000491761 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.08□□□□□ -1.28
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