RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 PRAC2D3DTV9 90 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 ERC2-IT1O76042 136 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-208ENST00000490669 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 Q6ZRP5 223 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 ORMDL3Q8N138 153 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 PSENENQ9NZ42 101 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 hDV103S1A0JD37 113 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 H7C423 109 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 M0R2N4 97 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 SH2D1AO60880 128 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 INSP01308 110 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 HCG22E2RYF7 251 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 FCER1GP30273 86 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-33P01772 117 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 CFC1BP0CG36 223 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 CFC1P0CG37 223 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 PRR9Q5T870 116 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 Q5VV11 94 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 M0R3E3 92 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 GAS8-AS1O95177 125 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 CHTF8P0CG12 524 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 HTN3P15516 51 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 C16orf74Q96GX8 76 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A096LNJ9 63 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 K7EMI3 77 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 TSHBP01222 138 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 PRSS1P07477 247 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 PRSS2P07478 247 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 DEFB130BP0DP73 79 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 DEFB130AP0DP74 79 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-208ENST00000490669 FAT1Q14517 4588 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A096LPF7 62 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 H3BNG1 76 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 Q6ZTI0 123 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 LIMD2Q9BT23 127 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC01546A6NGU7 62 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF815PA8K554 130 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 SPINK4O60575 86 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 COX6CP09669 75 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 PDE6HQ13956 83 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 SFTA2Q6UW10 78 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 Q8N814 137 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 PLNP26678 52 aa3.94□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.94□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A0J9YY99 117 aa3.93□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 HTN1P15515 57 aa3.93□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 MOBPQ13875 183 aa3.93□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 Q8TAT8 98 aa3.93□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 MYCBP2O75592 4640 aa3.93□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A087WVE0 104 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A087WYN8 130 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-30P01768 117 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 CCL18P55774 89 aa3.92□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC00315P59091 139 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.2 ms