RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa0.59□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 CACNA1EQ15878 2313 aa0.59□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 EFCAB6Q5THR3 1501 aa0.59□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.58□□□□□ -2.324e-7■■■■■ 27.9
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NELFCD-210ENST00000490205 CMC2Q9NRP2 79 aa0.56□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 CRIPTQ9P021 101 aa0.56□□□□□ -2.32
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NELFCD-210ENST00000490205 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 NMES1Q9C002 83 aa0.55□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.54□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 C2CD3Q4AC94 2353 aa0.54□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 A0A0D9SG42 100 aa0.54□□□□□ -2.32
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NELFCD-210ENST00000490205 PLCE1Q9P212 2302 aa0.54□□□□□ -2.32
NELFCD-210ENST00000490205 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
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NELFCD-210ENST00000490205 USF3Q68DE3 2245 aa0.5□□□□□ -2.33
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NELFCD-210ENST00000490205 NDUFA3O95167 84 aa0.5□□□□□ -2.33
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NELFCD-210ENST00000490205 LINC00158P58513 81 aa0.49□□□□□ -2.33
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NELFCD-210ENST00000490205 PIEZO1Q92508 2521 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 SPRR1BP22528 89 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 LELP1Q5T871 98 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.48□□□□□ -2.33
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.48□□□□□ -2.33
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