RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2BP63146 152 aa7.02□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 Q8NDZ9 215 aa7.02□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 M0R378 163 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 NCR3O14931 201 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFC2O95298 119 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 DIRC1Q969H9 104 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00167Q96N53 147 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV7-43P04211 117 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 TSTD3H0UI37 97 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 TAL2Q16559 108 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 C1orf137Q5JT78 98 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 LPAP08519 4548 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 A4D1N5 150 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 H0Y9J4 135 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2D-28P01615 120 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 DDTP30046 118 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 HSD52Q0P140 79 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 CEND1Q8N111 149 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 A6NDN8 102 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 XP32Q5T750 250 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM126AQ9H061 195 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV6-57P01721 117 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 PRYO14603 147 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 FXYD2P54710 66 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 CTAG1AP78358 180 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 RAB37Q96AX2 223 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 MUC2Q02817 5179 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 BCE1O60756 84 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 CFC1BP0CG36 223 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 CFC1P0CG37 223 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-217ENST00000481875 M0R143 59 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2AP49459 152 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0B4J2C4 111 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 H7C2G1 150 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF861PO60384 105 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 SPRR1AP35321 89 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 PRLHP81277 87 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 Q1RN00 199 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 C6orf99Q4VX62 202 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 VAMP3Q15836 100 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 BATFQ16520 125 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1B0GWB2 263 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 K7ERJ3 54 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 COX7BP24311 80 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 PRR4Q16378 134 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZRX8 168 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0U1RQV1 116 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 PSMB2P49721 201 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 A0A087X002 238 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A20O43772 301 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 TSPAN13O95857 204 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 CRYGAP11844 174 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 Q9BRP9 147 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-217ENST00000481875 H0YGX0 51 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 TRIAP1O43715 76 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 COX6CP09669 75 aa6.77□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 ERC2-IT1O76042 136 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 SNCGO76070 127 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00575Q6W349 94 aa6.75□□□□□ -1.33
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