RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A0U1RRA0 63 aa3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PANO1I0J062 215 aa3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NDUFC2O95298 119 aa3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.39□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A0B4J2C4 111 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FXYD2P54710 66 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BATFQ16520 125 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DAND5Q8N907 189 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RAB37Q96AX2 223 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.38□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1B0GWB2 263 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A4D1N5 150 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLPIP03973 132 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MT1HL1P0DM35 61 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPC2P61916 151 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q6ZRP5 223 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.37□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFC1BP0CG36 223 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFC1P0CG37 223 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE2BQ13066 116 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE2EQ4V326 116 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM126AQ9H061 195 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.36□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A087WYN8 130 aa3.35□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.35□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.35□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.35□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.35□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNF213Q63HN8 5207 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 M0R378 163 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX6CP09669 75 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHTF8P0CG12 524 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q1RN00 199 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.34□□□□□ -1.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRP2P98164 4655 aa3.34□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A096LNI7 61 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TAX1BP3O14907 124 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCR3O14931 201 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGKV2D-28P01615 120 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VPREB1P12018 145 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PSMB2P49721 201 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DPH3Q96FX2 82 aa3.33□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 K7ERJ3 54 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SNCGO76070 127 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSPAN13O95857 204 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV6-57P01721 117 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FABP2P12104 132 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VAMP3Q15836 100 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C7orf33Q8WU49 177 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C22orf24Q9Y442 160 aa3.32□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1W2PPM0 123 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H0YGX0 51 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H7C2G1 150 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 M0QXV9 152 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC01600Q96MT4 127 aa3.31□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 H3BUT2 72 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DIRC1Q969H9 104 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.3□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1B0GX51 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1W2PNN7 141 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM168BA1KXE4 195 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBE2BP63146 152 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATXN8Q156A1 80 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q8NDZ9 215 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00167Q96N53 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.28□□□□□ -1.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC25A20O43772 301 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms