RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.25□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.25□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 Q8NDZ9 215 aa6.24□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 A0A0U1RQV1 116 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 K7ERJ3 54 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 PRSS2P07478 247 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 CKS1BP61024 79 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 UBE2V1Q13404 147 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 SPANXCQ9NY87 97 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 TMEM238C9JI98 176 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-206ENST00000474188 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PPM0 123 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 A6NJY4 79 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 H3BUT2 72 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 CFC1BP0CG36 223 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 CFC1P0CG37 223 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 TPRXLQ17RH7 258 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 RAB37Q96AX2 223 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 A4D1N5 150 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 K7EP34 96 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 IFITM1P13164 125 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 HERV-K104P63124 156 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 PRLHP81277 87 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 VAMP3Q15836 100 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 COX7B2Q8TF08 81 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.18□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 A0A0B4J2C4 111 aa6.18□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 IGKV2D-28P01615 120 aa6.18□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 VPREB1P12018 145 aa6.17□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 CDIP1Q9H305 208 aa6.17□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 M0R378 163 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 CXCL5P42830 114 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 UBE2AP49459 152 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 SFTA2Q6UW10 78 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 FABP2P12104 132 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-206ENST00000474188 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.14□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 TMEM126AQ9H061 195 aa6.14□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 DAND5Q8N907 189 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 PFN2P35080 140 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 LCE2CQ5TA81 110 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.11□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 COPS9Q8WXC6 57 aa6.11□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 SPRR4Q96PI1 79 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 PRO0461Q9UI25 63 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 ERG28Q9UKR5 140 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 NPC2P61916 151 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-206ENST00000474188 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.08□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 A0A0U1RRA0 63 aa6.08□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 COX17Q14061 63 aa6.08□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.08□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 TCL1BO95988 128 aa6.07□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 LINC00158P58513 81 aa6.07□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.07□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 F8W1H4 67 aa6.06□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 H3BMG7 143 aa6.06□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 TRIAP1O43715 76 aa6.06□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.06□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.05□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 Q8NBF4 154 aa6.05□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.04□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.04□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 H7C2G1 150 aa6.03□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 NDUFC2O95298 119 aa6.03□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 SPRR1AP35321 89 aa6.03□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 PSMB2P49721 201 aa6.03□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.03□□□□□ -1.44
NISCH-206ENST00000474188 ERC2-IT1O76042 136 aa6.02□□□□□ -1.45
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