RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469653.5

SEMA4D-215, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

TSL 2

Gene SEMA4D, Length 3,533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.83□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 LCA10Q71F78 164 aa6.83□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 UPK3BQ9BT76 320 aa6.83□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6JHZ5 121 aa6.82□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.82□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.82□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 CCKP06307 115 aa6.82□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.81□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 H0YGX0 51 aa6.8□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.8□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.8□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.79□□□□□ -1.32
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SEMA4D-215ENST00000469653 PSPHP1O15172 72 aa6.79□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.77□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 H0Y9J4 135 aa6.77□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 UBE2BP63146 152 aa6.77□□□□□ -1.32
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.77□□□□□ -1.33
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SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.76□□□□□ -1.33
SEMA4D-215ENST00000469653 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZTC4 211 aa6.75□□□□□ -1.33
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC01554Q52M75 96 aa6.74□□□□□ -1.33
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.74□□□□□ -1.33
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00167Q96N53 147 aa6.73□□□□□ -1.33
SEMA4D-215ENST00000469653 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.73□□□□□ -1.33
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SEMA4D-215ENST00000469653 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.72□□□□□ -1.33
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SEMA4D-215ENST00000469653 Q8N814 137 aa6.72□□□□□ -1.33
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SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.71□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.71□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 EPM2AB3EWF7 344 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 KLK12Q9UKR0 248 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 F8WEM9 126 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 A8MU10 97 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 UBE2AP49459 152 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 Q8NDZ9 215 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 RMI2Q96E14 147 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.69□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.69□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 MUC7Q8TAX7 377 aa6.69□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 C10orf25Q5T742 122 aa6.69□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZQY7 126 aa6.69□□□□□ -1.34
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SEMA4D-215ENST00000469653 Q8IZM0 81 aa6.67□□□□□ -1.34
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SEMA4D-215ENST00000469653 NUPR2A6NF83 97 aa6.67□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.66□□□□□ -1.34
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SEMA4D-215ENST00000469653 TENM2Q9NT68 2774 aa6.66□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 KIAA0087Q14695 138 aa6.66□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.66□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 FAM229AH3BQW9 127 aa6.65□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZQT0 140 aa6.64□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 PRAC1Q96KF2 57 aa6.64□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 H7BZZ5 65 aa6.64□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 CASC10Q5T4H9 136 aa6.64□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A1B0GUV1 79 aa6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00575Q6W349 94 aa6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 DIRC1Q969H9 104 aa6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 H3BNG1 76 aa6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 SPAG11BQ08648 103 aa6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 LYSTQ99698 3801 aa6.63□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.62□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 ESRGQ1W209 222 aa6.62□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 APLNQ9ULZ1 77 aa6.62□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A0G2JQZ4 141 aa6.61□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A1W2PNN7 141 aa6.61□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.61□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 COX17Q14061 63 aa6.6□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.6□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.6□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.6□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.59□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.59□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 BPY2O14599 106 aa6.59□□□□□ -1.35
SEMA4D-215ENST00000469653 A6NED7 52 aa6.59□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.59□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 HCG22E2RYF7 251 aa6.58□□□□□ -1.36
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