RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468641.1

PTPRZ1-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRZ1, Length 554 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-203ENST00000468641 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.18□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CLIP1P30622 1438 aa-0.19□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.19□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 NCOA2Q15596 1464 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 M0R2T5 61 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 COL6A3P12111 3177 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 APC2O95996 2303 aa-0.2□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CCL22O00626 93 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 SPRR2BP35325 72 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.21□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.22□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 ACYP1P07311 99 aa-0.22□□□□□ -2.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 RGPD5Q99666 1765 aa-0.22□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 C4AP0C0L4 1744 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 C4BP0C0L5 1744 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 NDUFA3O95167 84 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ERVK-7P63135 1459 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.23□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 LYSTQ99698 3801 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 MUC2Q02817 5179 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ST20Q9HBF5 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ACANP16112 2415 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZANQ9Y493 2812 aa-0.24□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.25□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 PKHD1P08F94 4074 aa-0.25□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 IFI6P09912 130 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 PKD1P98161 4303 aa-0.26□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRANK1O15050 2925 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 NWD1Q149M9 1564 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 NESP48681 1621 aa-0.27□□□□□ -2.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 H3BUT2 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.29□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.29□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 LCE6AA0A183 80 aa-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 ADIRFQ15847 76 aa-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 AKAP13Q12802 2813 aa-0.3□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.31□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 S100A13Q99584 98 aa-0.31□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.33□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.33□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.33□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 NDUFB1O75438 58 aa-0.33□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.33□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 WIZO95785 1651 aa-0.33□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.34□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.34□□□□□ -2.46
PTPRZ1-203ENST00000468641 RICTORQ6R327 1708 aa-0.35□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.35□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.35□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.35□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.35□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 NBASA2RRP1 2371 aa-0.36□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 H0YAA0 97 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 NREPQ16612 68 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 PLXNC1O60486 1568 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 ABCA8O94911 1581 aa-0.37□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.38□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.38□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 TJP1Q07157 1748 aa-0.38□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 ABCC1P33527 1531 aa-0.38□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.39□□□□□ -2.47
PTPRZ1-203ENST00000468641 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms