RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf137Q5JT78 98 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 K7ERJ3 54 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 BCE1O60756 84 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 REG3GQ6UW15 175 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 A6NDN8 102 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 H0Y9J4 135 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB37Q96AX2 223 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 B5MCH6 92 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 TSPAN13O95857 204 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV7-43P04211 117 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2AP49459 152 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 C6orf99Q4VX62 202 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZRX8 168 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 DIRC1Q969H9 104 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF861PO60384 105 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 Q9BRP9 147 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 MYCBP2O75592 4640 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIAP1O43715 76 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 PRLHP81277 87 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 TAX1BP3O14907 124 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 COX7BP24311 80 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 BATFQ16520 125 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 H7C2G1 150 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 Q1RN00 199 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 TNXBP22105 4242 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 C9orf118A6NHY6 69 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 H0YGX0 51 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 J3QL48 77 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 ERC2-IT1O76042 136 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 OXTP01178 125 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00575Q6W349 94 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GX51 115 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 VAMP3Q15836 100 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00483Q53H64 154 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 LST1O00453 97 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 SPRR1BP22528 89 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 SPRR4Q96PI1 79 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PPM0 123 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BUT2 72 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 COX6CP09669 75 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 PSMB2P49721 201 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 CLEC2BQ92478 149 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 hADV29S1A0JD25 119 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 TRACP01848 142 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 TCL1BO95988 128 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01600Q96MT4 127 aa5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A20O43772 301 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZQY7 126 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 CRYGAP11844 174 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 FABP2P12104 132 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM29Q86T20 159 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 SNCGO76070 127 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 ATXN8Q156A1 80 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 Q8N377 158 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A087X002 238 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms