RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417797.1

USP9YP13-201, Transcript of USP9Y pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP13, Length 480 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP13-201ENST00000417797 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP0.11□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 PTPN13Q12923 2485 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 SPINK4O60575 86 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 LELP1Q5T871 98 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 TJP1Q07157 1748 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 MYO5CQ9NQX4 1742 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 PTPN23Q9H3S7 1636 aa0.09□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 KNL1Q8NG31 2342 aa0.09□□□□□ -2.39
USP9YP13-201ENST00000417797 CEBPZOSA8MTT3 80 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 SPRR2DP22532 72 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 GAFA1Q96PS6 74 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 NCOA2Q15596 1464 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 ATRQ13535 2644 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 ABCA8O94911 1581 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 CLIP1P30622 1438 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 TRAV21A0A0B4J279 112 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 ITSN1Q15811 1721 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 CACNA1AO00555 2505 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 IQGAP3Q86VI3 1631 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 LPAP08519 4548 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 LOC730098B7Z3J9 87 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 ACYP1P07311 99 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 WIZO95785 1651 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 NRAPQ86VF7 1730 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 CCL22O00626 93 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 WFDC9Q8NEX5 89 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 REV3LO60673 3130 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 COL7A1Q02388 2944 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 SSPOA2VEC9 5147 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 HEPN1Q6WQI6 88 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 ST20Q9HBF5 79 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 APC2O95996 2303 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 MAP3K1Q13233 1512 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 RPL38P63173 70 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 ADIRFQ15847 76 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 S100A13Q99584 98 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP13-201ENST00000417797 HSPG2P98160 4391 aa0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 ABCC1P33527 1531 aa0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 M0R2T5 61 aa0.02□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.02□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 CCDC88BA6NC98 1476 aa0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 PLXNC1O60486 1568 aa0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 NHSQ6T4R5 1651 aa0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 H3BUT2 72 aa0□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 NDUFB1O75438 58 aa0□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 FLNCQ14315 2725 aa-0□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 NDUFA3O95167 84 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 ACANP16112 2415 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 IFI6P09912 130 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP13-201ENST00000417797 NBASA2RRP1 2371 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 SPRR2BP35325 72 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 DEPDC5O75140 1603 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 NREPQ16612 68 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 LCE6AA0A183 80 aa-0.06□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.06□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 LRP2P98164 4655 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 A0A087WXM4 84 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 COL6A3P12111 3177 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.08□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 NDUFA4O00483 81 aa-0.08□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-0.08□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 ZANQ9Y493 2812 aa-0.09□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.09□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.09□□□□□ -2.42
USP9YP13-201ENST00000417797 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms