RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C5orf17Q8NAS9 161 aa1.85□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFA4O00483 81 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEFB131AP59861 70 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC00526Q96FQ7 95 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPANXDQ9BXN6 97 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BET1LQ9NYM9 111 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.84□□□□□ -2.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAH5Q8TE73 4624 aa1.84□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H3BRN7 92 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 I3L2K1 104 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL5P05113 134 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPINK8P0C7L1 97 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADCYAP1P18509 176 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C9orf153Q5TBE3 101 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q6AWC8 147 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATG5Q9H1Y0 275 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa1.83□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDCD5O14737 125 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MPC2O95563 127 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPYP01298 95 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFITM1P13164 125 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FXYD4P59646 89 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEFB1P60022 68 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPINK9Q5DT21 86 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LYPD1Q8N2G4 141 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM14BQ9NUH8 114 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RABAC1Q9UI14 185 aa1.82□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRAV2A0A0B4J234 112 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFB6O95139 128 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1-17P01599 117 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HTN3P15516 51 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 S100A10P60903 97 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMG4Q5JS54 123 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SVBPQ8N300 66 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR10AG1Q8NH19 301 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNHG12Q9BXW3 62 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFA12Q9UI09 145 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USH2AO75445 5202 aa1.81□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNCGO76070 127 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGHV3-33P01772 117 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPART-AS1P0CW21 52 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRCDQ00LT1 54 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GDF5OSQ5U4N7 250 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q8N8P6 123 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LINC00052Q96N35 136 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FXYD6Q9H0Q3 95 aa1.8□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 F8W1H4 67 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGLC1P0CG04 106 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNCAP37840 140 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPANXN1Q5VSR9 72 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DSCR8Q96T75 97 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRO0461Q9UI25 63 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.79□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KMT2DO14686 5537 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEFB130BP0DP73 79 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEFB130AP0DP74 79 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC25A6P12236 298 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COX7CP15954 63 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPC2P61916 151 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RHOHQ15669 191 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM141Q96I45 108 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TXNDC17Q9BRA2 123 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ORMDL1Q9P0S3 153 aa1.78□□□□□ -2.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKCP01834 107 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL7P13232 177 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBE2G1P62253 170 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 S100A7L2Q5SY68 101 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CSAG1Q6PB30 78 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C15orf53Q8NAA6 179 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSKUQ8WUA8 353 aa1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A0J9YY99 117 aa1.76□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CEBPZOSA8MTT3 80 aa1.76□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A8MTW9 85 aa1.76□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM262E9PQX1 116 aa1.76□□□□□ -2.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms