RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 LITAFQ99732 161 aa4.99□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.99□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.99□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.98□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 S100A6P06703 90 aa4.98□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 IFITM1P13164 125 aa4.98□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.98□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.98□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZRX8 168 aa4.98□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPAN13O95857 204 aa4.97□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR4Q16378 134 aa4.97□□□□□ -1.61
MT-TS1-201ENST00000387416 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.97□□□□□ -1.61
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MT-TS1-201ENST00000387416 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.96□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 NPC2P61916 151 aa4.96□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00483Q53H64 154 aa4.96□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.96□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.96□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.95□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.95□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.95□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.95□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.94□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.94□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.94□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.94□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 Q9BRP9 147 aa4.94□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.94□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 SPINK1P00995 79 aa4.93□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.93□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 ATOH7Q8N100 152 aa4.93□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 ERC2-IT1O76042 136 aa4.92□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 PCP2Q8IVA1 136 aa4.92□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.91□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 A4D1N5 150 aa4.91□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 COX7BP24311 80 aa4.91□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8NBF4 154 aa4.91□□□□□ -1.62
MT-TS1-201ENST00000387416 SCGB1D1O95968 90 aa4.9□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.9□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.89□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GWB2 263 aa4.89□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 A6NDN8 102 aa4.89□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 SPRR1BP22528 89 aa4.89□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 C6orf99Q4VX62 202 aa4.89□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.88□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 MOBPQ13875 183 aa4.88□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 TPRXLQ17RH7 258 aa4.88□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.88□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 VAMP3Q15836 100 aa4.87□□□□□ -1.63
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MT-TS1-201ENST00000387416 DLEU1O43261 78 aa4.86□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A20O43772 301 aa4.86□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 TAL2Q16559 108 aa4.86□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.86□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.86□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.86□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 COX8AP10176 69 aa4.85□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CDIP1Q9H305 208 aa4.85□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST1H4GQ99525 98 aa4.84□□□□□ -1.63
MT-TS1-201ENST00000387416 LPAP08519 4548 aa4.84□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.83□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 CD164Q04900 197 aa4.83□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.83□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 PRO1933Q9H354 126 aa4.83□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.82□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 LIMD2Q9BT23 127 aa4.82□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 HIGD1BQ9P298 99 aa4.82□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0U1RQV1 116 aa4.81□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 SNCGO76070 127 aa4.81□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N377 158 aa4.81□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 VAMP8Q9BV40 100 aa4.81□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA45Q537H7 98 aa4.8□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.8□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00575Q6W349 94 aa4.8□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF213Q63HN8 5207 aa4.8□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 hADV29S1A0JD25 119 aa4.79□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 H7C2G1 150 aa4.79□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 Q1RN00 199 aa4.79□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.79□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 C14orf144Q96I85 54 aa4.79□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 F8WEM9 126 aa4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 Q5XG85 94 aa4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM29Q86T20 159 aa4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB37Q96AX2 223 aa4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.78□□□□□ -1.64
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.77□□□□□ -1.65
MT-TS1-201ENST00000387416 A6NJY4 79 aa4.77□□□□□ -1.65
MT-TS1-201ENST00000387416 H0YGX0 51 aa4.77□□□□□ -1.65
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6JHZ5 121 aa4.77□□□□□ -1.65
MT-TS1-201ENST00000387416 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0B4J2C4 111 aa4.76□□□□□ -1.65
MT-TS1-201ENST00000387416 GHRHP01286 108 aa4.76□□□□□ -1.65
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