RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-201ENST00000332175 PRR34Q9NV39 138 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRM-201ENST00000332175 Q8N377 158 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 A0A096LNT2 108 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 RPS28P62857 69 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 A8MUN3 132 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GVX0 72 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 CASC10Q5T4H9 136 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 PRR15Q8IV56 129 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PTPRM-201ENST00000332175 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV7-43P04211 117 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRM-201ENST00000332175 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRM-201ENST00000332175 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRM-201ENST00000332175 POLQO75417 2590 aa14.52□□□□□ -0.09
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PTPRM-201ENST00000332175 ERC2-IT1O76042 136 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRM-201ENST00000332175 MTORP42345 2549 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC01554Q52M75 96 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRM-201ENST00000332175 SPRR4Q96PI1 79 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-201ENST00000332175 ACANP16112 2415 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-201ENST00000332175 CRIPTQ9P021 101 aa14.41□□□□□ -0.1
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PTPRM-201ENST00000332175 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF575Q86XF7 245 aa14.39□□□□□ -0.11
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PTPRM-201ENST00000332175 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0D9SG42 100 aa14.38□□□□□ -0.11
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PTPRM-201ENST00000332175 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM104AQ969W3 186 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRM-201ENST00000332175 H7BZZ5 65 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRM-201ENST00000332175 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZSA8 131 aa14.13□□□□□ -0.15
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PTPRM-201ENST00000332175 LCA10Q71F78 164 aa13.86□□□□□ -0.19
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PTPRM-201ENST00000332175 UTRNP46939 3433 aa13.83□□□□□ -0.19
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PTPRM-201ENST00000332175 Q8NDZ9 215 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
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PTPRM-201ENST00000332175 Q1T7F1 81 aa13.73□□□□□ -0.21
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PTPRM-201ENST00000332175 Q5VSD8 79 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRM-201ENST00000332175 Q5W150 140 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRM-201ENST00000332175 SPRR1AP35321 89 aa13.58□□□□□ -0.23
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PTPRM-201ENST00000332175 SPINK7P58062 85 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP10-1P60331 282 aa13.51□□□□□ -0.25
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP10-2P60368 255 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRM-201ENST00000332175 ITPR3Q14573 2671 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRM-201ENST00000332175 CEP350Q5VT06 3117 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRM-201ENST00000332175 R4GN34 69 aa13.45□□□□□ -0.26
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