RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA6P56556 154 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 B5MCH6 92 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BS24 57 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 NCR3O14931 201 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00614P0C842 121 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCYAP1P18509 176 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZRX8 168 aa4.2□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RRA0 63 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GV90 55 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8NDZ9 215 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 DDTP30046 118 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HERV-K104P63124 156 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf144Q96I85 54 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.17□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ERC2-IT1O76042 136 aa4.17□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 CD164Q04900 197 aa4.17□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.17□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.17□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM13P0DJ93 91 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9BRP9 147 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf202A1L168 122 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01546A6NGU7 62 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 H7C2G1 150 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCC3Q6UW78 93 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PRO1933Q9H354 126 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 C9JQL5 133 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 BAGE3Q86Y29 109 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 COX19Q49B96 90 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 Q5XG85 94 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf86A6NJI1 115 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 DLEU1O43261 78 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TCL1BO95988 128 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 HBDP02042 147 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR1BP22528 89 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SVBPQ8N300 66 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM218A2RU14 115 aa4.11□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 APOC3P02656 99 aa4.11□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.11□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM223A0PJW6 202 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TSTD3H0UI37 97 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFC2O95298 119 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TAL2Q16559 108 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.1□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf195Q5TG92 126 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC11CQ9BY50 192 aa4.09□□□□□ -1.75
PGGT1B-201ENST00000296642 COLCA2A8K830 154 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf99Q4VX62 202 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM29Q86T20 159 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 SSPOA2VEC9 5147 aa4.08□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 USH2AO75445 5202 aa4.07□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.07□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 RHEBQ15382 184 aa4.07□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 PYY3Q5JQD4 70 aa4.07□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.06□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 Q1RN00 199 aa4.06□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 Q75L30 129 aa4.06□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 PCP2Q8IVA1 136 aa4.06□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM236CP0DP71 79 aa4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A2P29034 98 aa4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 NMUP48645 174 aa4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R143 59 aa4.04□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-10P60014 251 aa4.04□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 HERVK_113P61574 105 aa4.04□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.04□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A096LNJ9 63 aa4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 COX7BP24311 80 aa4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PGGT1B-201ENST00000296642 F8WEM9 126 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1B-201ENST00000296642 LEPROTO15243 131 aa4.02□□□□□ -1.77
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