RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.34□□□□□ -0.59
PTX4-201ENST00000293922 IGLV6-57P01721 117 aa11.34□□□□□ -0.59
PTX4-201ENST00000293922 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
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PTX4-201ENST00000293922 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.91□□□□□ -0.66
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PTX4-201ENST00000293922 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.89□□□□□ -0.67
PTX4-201ENST00000293922 SPRR4Q96PI1 79 aa10.89□□□□□ -0.67
PTX4-201ENST00000293922 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTX4-201ENST00000293922 K7EP34 96 aa10.87□□□□□ -0.67
PTX4-201ENST00000293922 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.87□□□□□ -0.67
PTX4-201ENST00000293922 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
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