RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.88□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.88□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.87□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.87□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.87□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.87□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 A6NDN8 102 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 A6NJY4 79 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 TMEM238C9JI98 176 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 MT1HP80294 61 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 Q6ZVH6 145 aa5.86□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 GAGE10A6NGK3 116 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 TIMM17BO60830 172 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 CXCL5P42830 114 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 HERV-K104P63124 156 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.85□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 SPINK8P0C7L1 97 aa5.84□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 BATFQ16520 125 aa5.84□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 CEND1Q8N111 149 aa5.84□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 DAND5Q8N907 189 aa5.84□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 COPS9Q8WXC6 57 aa5.84□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.84□□□□□ -1.47
USP41-201ENST00000292729 A0A0J9YXY3 114 aa5.83□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 PRLHP81277 87 aa5.83□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 HIST1H4GQ99525 98 aa5.83□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 SPINK1P00995 79 aa5.82□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.82□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 XP32Q5T750 250 aa5.82□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.82□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.82□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 SPANXCQ9NY87 97 aa5.82□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.81□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 IGKV2D-28P01615 120 aa5.81□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 IFITM1P13164 125 aa5.81□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 COX7B2Q8TF08 81 aa5.81□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 TMEM126AQ9H061 195 aa5.8□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GWB2 263 aa5.79□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 FXYD2P54710 66 aa5.79□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 SMIM13P0DJ93 91 aa5.78□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 Q8NBF4 154 aa5.78□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 LITAFQ99732 161 aa5.78□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
USP41-201ENST00000292729 A0A0B4J2C4 111 aa5.77□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 TAX1BP3O14907 124 aa5.77□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.77□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 SPRR4Q96PI1 79 aa5.77□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 C9orf118A6NHY6 69 aa5.76□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 M0R378 163 aa5.76□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 COX17Q14061 63 aa5.76□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.76□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GV90 55 aa5.75□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.75□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 M0R2T5 61 aa5.74□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 SLC25A20O43772 301 aa5.73□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 VPREB1P12018 145 aa5.73□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.73□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 Q8N377 158 aa5.73□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 ERG28Q9UKR5 140 aa5.73□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 A4D1N5 150 aa5.72□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.72□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 RAB37Q96AX2 223 aa5.72□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.72□□□□□ -1.49
USP41-201ENST00000292729 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 CFC1P0CG37 223 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 FABP2P12104 132 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.71□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 A0A1W2PPM0 123 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 H3BUT2 72 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 K7ERJ3 54 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 VAMP3Q15836 100 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 PCOTHQ58A44 107 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.7□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 LINC00158P58513 81 aa5.69□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.69□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.68□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 K7EP34 96 aa5.68□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 NDUFC2O95298 119 aa5.68□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 PFN2P35080 140 aa5.68□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 UBE2V1Q13404 147 aa5.68□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 LINC00483Q53H64 154 aa5.68□□□□□ -1.5
USP41-201ENST00000292729 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms