RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PNN7 141 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 SPRR1BP22528 89 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 Q1T7F1 81 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 SPRR1AP35321 89 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 CRIPTQ9P021 101 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 OCR1Q9BZK8 76 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 LCA10Q71F78 164 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 CASC10Q5T4H9 136 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 Q75L30 129 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 LRRK2Q5S007 2527 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 MUC4Q99102 2169 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf92A6NGG3 77 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00483Q53H64 154 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 HRES1P13985 223 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZSA8 131 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 TNP2Q05952 138 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 DMAC1Q96GE9 116 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 LCE6AA0A183 80 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GU33 70 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0G2JQZ4 141 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 S4R3F8 94 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N1X5 172 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 CSAG1Q6PB30 78 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 OXTP01178 125 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 Q5W150 140 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZR54 194 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 Q8NDZ9 215 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 CR1P17927 2039 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 JMJD1CQ15652 2540 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 LUZP6Q538Z0 58 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 Q5XG85 94 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 F8P00451 2351 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0D9SG42 100 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 Q5VV11 94 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 SPINK7P58062 85 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 Q5VSD8 79 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-1P60331 282 aa5.34□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01554Q52M75 96 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087X002 238 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 ROMO1P60602 79 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 EP400Q96L91 3159 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 R4GN34 69 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 MTORP42345 2549 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-2P60368 255 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 M0R2T5 61 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.25□□□□□ -1.57
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