RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 ENHOQ6UWT2 76 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 PDZD2O15018 2839 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 H7C423 109 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 MT-ATP8P03928 68 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 CHTF8P0CG12 524 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 RTL8CO15255 209 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC179H3BU77 68 aa4.21□□□□□ -1.73
TMOD2-201ENST00000249700 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 EPM2AB3EWF7 344 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 LST1O00453 97 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 TIMM17BO60830 172 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 LITAFQ99732 161 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 CR1P17927 2039 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1B0GW54 56 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 PRO0628Q9UI54 55 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 C8orf87E5RJ46 101 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 IGKV2-30P06310 120 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 hDV103S1A0JD37 113 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 F8WDY8 70 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 CCKP06307 115 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 M0R378 163 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 TENM3Q9P273 2699 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 PRLHP81277 87 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 PRO0461Q9UI25 63 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 C6orf99Q4VX62 202 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 BCE1O60756 84 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 Q8NAQ8 132 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 Q9BRP9 147 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 H3BPC8 53 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 COX7CP15954 63 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP10-11P60412 298 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 Q6JHZ5 121 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 MOBPQ13875 183 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 LUZP6Q538Z0 58 aa4.15□□□□□ -1.74
TMOD2-201ENST00000249700 BSNQ9UPA5 3926 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.15□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 Q6ZRP5 223 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 C9orf92A6NGG3 77 aa4.14□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 CRYGAP11844 174 aa4.13□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.13□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1B0GUV1 79 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 Q6ZQY7 126 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 CUBNO60494 3623 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 Q8IZM0 81 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 Q96NJ1 140 aa4.12□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 ACYP2P14621 99 aa4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 A0A087WYN8 130 aa4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 ERC2-IT1O76042 136 aa4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 LINC01554Q52M75 96 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 PCOTHQ58A44 107 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 KIAA0087Q14695 138 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 CRIPTQ9P021 101 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD2-201ENST00000249700 A0A0A0MQY5 61 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD2-201ENST00000249700 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD2-201ENST00000249700 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD2-201ENST00000249700 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
TMOD2-201ENST00000249700 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms