RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr148Q60887 310 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp983E9PUT0 460 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm6871L7N248 545 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sult1b1Q9QWG7 299 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr624F8VQI7 308 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bloc1s1O55102 125 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hoxd3P09027 433 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 H2al1jA2BFR3 109 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm6096D3YTY6 151 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr779E9PUS9 130 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 EtdQ80SW5 59 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Avpi1Q9D7H4 142 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trav6n-5A0A075B621 112 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm9767G3X930 207 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Socs3O35718 225 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp36l1P23950 338 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr963Q7TRA9 311 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hivep1Q03172 2688 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc25a29Q8BL03 306 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1440Q8VFV4 315 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rpp30O88796 268 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P01674 108 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ube2g1P62254 170 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gal3st4Q3V1B8 480 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 2810408A11RikQ6NSU2 435 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1445Q8VFW9 314 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SNORCQ9CXL7 121 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxo25Q9D2Y6 357 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Itpr2Q9Z329 2701 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trbv3A0A0A6YYE2 117 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr16Q62007 309 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 UrahQ9CRB3 118 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nat8f7E0CYR6 227 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm26661M0QWV4 156 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Crisp3Q03402 241 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ripply2Q2WG76 128 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1246Q7TQZ6 314 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Oraov1Q8CH62 137 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trpt1Q8K3A2 249 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ube2e2Q91W82 201 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Notch2O35516 2470 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 KprpB2RUR4 657 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr235E9Q9Z6 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21900J3QP38 180 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam222aQ6PGH4 453 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1228Q8VGM9 323 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr553Q7TRS6 326 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RhebQ921J2 184 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr35Q9ES90 307 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vamp5Q9Z2P8 102 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr715bE9Q725 315 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Foxh1O88621 401 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnase1P00683 149 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tac3P55099 116 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr715Q8VG49 315 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 V1ra8Q9EQ48 279 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smco4Q9JIS3 59 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IfngP01580 155 aa9.94□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scgb1b29D2XZ31 93 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scgb1b20E9PWZ2 93 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbln7Q501P1 440 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bpifb3Q80ZU7 473 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stxbp6Q8R3T5 210 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd99Q8VCN6 175 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf580Q9DB38 172 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tomm40Q9QYA2 361 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5741B2RVA4 72 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Foxc2Q61850 494 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q8C3M9 231 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AY761184Q9D848 116 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm8439G3UWA7 96 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smim9Q3V0X1 137 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q4KKZ1 196 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc35d2Q762D5 326 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcnip3Q9QXT8 256 aa9.93□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr709-ps1A0A140T8J9 307 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LfngO09010 378 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fli1P26323 452 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm16686Q3UMN9 131 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp6v0bQ91V37 205 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5464Q3UY29 175 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scgb3a2Q920H1 91 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q9CRC3 126 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GgctQ9D7X8 188 aa9.92□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa9.91□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa9.91□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc71lE9Q4T4 218 aa9.91□□□□□ -0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxl7Q5BJ29 491 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms