RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589916.5

BCAS3-223, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

TSL 2

Gene BCAS3, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-223	ENST00000589916	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.64	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.64	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916		A0A0U1RQV1	116 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	NDUFA1	O15239	70 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.63	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916		H3BS24	57 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	COX8A	P10176	69 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.62	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916		Q6ZSA8	131 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.61	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	TIMM17B	O60830	172 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	LINC00158	P58513	81 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	COX17	Q14061	63 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916		Q6ZVH6	145 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	PCP2	Q8IVA1	136 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.6	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916		A0A087WTM6	91 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916		A0A0J9YXY3	114 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	LECT2	O14960	151 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	HAMP	P81172	84 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	C2orf82	Q6UX34	121 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	ERG28	Q9UKR5	140 aa		3.59	□□□□□ -1.83
BCAS3-223	ENST00000589916	IFITM1	P13164	125 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	PFN2	P35080	140 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	TAL2	Q16559	108 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916		Q6ZRU5	148 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916		Q8N814	137 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	HSD52	Q0P140	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916		A0A0U1RRA0	63 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916		A0A1B0GV72	72 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	WFDC2	Q14508	124 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	C10orf25	Q5T742	122 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916		A6NDN8	102 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	CEND1	Q8N111	149 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.54	□□□□□ -1.84
BCAS3-223	ENST00000589916	CDIP1	Q9H305	208 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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