RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582486.5

GGA3-213, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GGA3, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-213ENST00000582486 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-213ENST00000582486 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.45□□□□□ -1.22
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GGA3-213ENST00000582486 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-213ENST00000582486 TRIAP1O43715 76 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-213ENST00000582486 IGKV2D-28P01615 120 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-213ENST00000582486 ATXN8Q156A1 80 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-213ENST00000582486 LINC01620Q4KN68 170 aa7.43□□□□□ -1.22
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GGA3-213ENST00000582486 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.42□□□□□ -1.22
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GGA3-213ENST00000582486 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.41□□□□□ -1.22
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GGA3-213ENST00000582486 CASC10Q5T4H9 136 aa7.4□□□□□ -1.22
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GGA3-213ENST00000582486 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GGA3-213ENST00000582486 C2orf48Q96LS8 159 aa7.39□□□□□ -1.23
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GGA3-213ENST00000582486 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.38□□□□□ -1.23
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GGA3-213ENST00000582486 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.34□□□□□ -1.23
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GGA3-213ENST00000582486 Q6ZRP5 223 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-213ENST00000582486 H0YGX0 51 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-213ENST00000582486 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.28□□□□□ -1.24
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GGA3-213ENST00000582486 IGLV6-57P01721 117 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 DNAH2Q9P225 4427 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 A0A087WYN8 130 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 M0R2N4 97 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 TRACP01848 142 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 SEC61GP60059 68 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 C6orf99Q4VX62 202 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 ACYP1P07311 99 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 M0R378 163 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-213ENST00000582486 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 IMUPQ9GZP8 106 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-213ENST00000582486 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 DNAL4O96015 105 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 FAM168BA1KXE4 195 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 C14orf177Q52M58 125 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-213ENST00000582486 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 Q8N814 137 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-213ENST00000582486 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.19□□□□□ -1.26
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