RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PKIA	P61925	76 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFA5	Q01523	94 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PEA15	Q15121	130 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF56	Q15929	161 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6ZS92	163 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB106A	Q8N104	65 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LCN9	Q8WX39	176 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00208	Q96KT6	92 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ODF3	Q96PU9	254 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	VAMP8	Q9BV40	100 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CMC2	Q9NRP2	79 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PKHD1	P08F94	4074 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ITPR2	Q14571	2701 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MUC3A	Q02505	3323 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TNC	P24821	2201 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A087WSZ3	146 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	RBAKDN	A6NC62	111 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	HIGD1C	A8MV81	97 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	UMAD1	C9J7I0	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BQ15	152 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		M0R3E3	92 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	HMGN4	O00479	90 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP1R17	O96001	155 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TNF	P01375	233 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MT-ATP8	P03928	68 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	C3orf79	P0CE67	100 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLC1	P0CG04	106 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PDE6G	P18545	87 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ASIP	P42127	132 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PI4KA	P42356	2102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SEC11A	P67812	179 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FXYD3	Q14802	87 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6AWC8	147 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6ZQY7	126 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		Q8N8P6	123 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DMAC1	Q96GE9	116 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CCL19	Q99731	98 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	C20orf78	Q9BR46	151 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PROK2	Q9HC23	129 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	C22orf24	Q9Y442	160 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		V9GYV3	84 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PKD1	P98161	4303 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MUC4	Q99102	2169 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	IGF2R	P11717	2491 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	USP24	Q9UPU5	2620 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	NCOR1	O75376	2440 aa		0.35	□□□□□ -2.35

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