RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556616.5

PRMT5-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 4

Gene PRMT5, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-223	ENST00000556616	DAND5	Q8N907	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	CKS1B	P61024	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616		Q6ZVQ6	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	NDUFC2	O95298	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00158	P58513	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	NPC2	P61916	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRMT5-223	ENST00000556616	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	PFN2	P35080	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	XG	P55808	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	RMI2	Q96E14	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	TCL1B	O95988	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		F8W1H4	67 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		M0QXV9	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		Q6ZRU5	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		H3BMG7	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		Q8NDZ9	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		Q9HAA7	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		H7C2G1	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	LST1	O00453	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	PSMB2	P49721	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	COX6C	P09669	75 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		Q1RN00	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRMT5-223	ENST00000556616	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.78	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	WFDC2	Q14508	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	TRAC	P01848	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		Q6ZRP5	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		H0YGX0	51 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		Q6ZR54	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		A0A1B0GX51	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		C9JAW5	83 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		H3BT86	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	SLC25A20	O43772	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	NCR3	O14931	201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRMT5-223	ENST00000556616		M0R378	163 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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