RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 VPREB1P12018 145 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf195Q5TG92 126 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM29Q86T20 159 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 PCOTHQ58A44 107 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 PRR4Q16378 134 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 A8MWP4 228 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 CDIP1Q9H305 208 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 TNCP24821 2201 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRB-208ENST00000550358 LITAFQ99732 161 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 PRO0461Q9UI25 63 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 CREBBPQ92793 2442 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GU69 56 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 K7EIL1 84 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2-30P06310 120 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 UTRNP46939 3433 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF292O60281 2723 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0U1RQV1 116 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 PMAIP1Q13794 54 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF861PO60384 105 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-11P60412 298 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 ACACBO00763 2458 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-208ENST00000550358 NBASA2RRP1 2371 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 C15orf56Q8N910 161 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WTM6 91 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 SPINK1P00995 79 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF575Q86XF7 245 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 APLNQ9ULZ1 77 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 CD164Q04900 197 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 WIPF1O43516 503 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 AGRNO00468 2067 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 MED13LQ71F56 2210 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 J3QL48 77 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 Q96NJ1 140 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 PRO0628Q9UI54 55 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GVX0 72 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 PRR15Q8IV56 129 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-3P60369 221 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 PLXNB1O43157 2135 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV7-43P04211 117 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 IGFL1Q6UW32 110 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 PSPHP1O15172 72 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 Q9UF83 564 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 CHTF8P0CG12 524 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01600Q96MT4 127 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 SPRR4Q96PI1 79 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 FAM168BA1KXE4 195 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N377 158 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 K7EQZ3 153 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 KLKP1Q107X0 134 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-208ENST00000550358 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 ATRXP46100 2492 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 COA5Q86WW8 74 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 UQCR11O14957 56 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 FAM104AQ969W3 186 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-208ENST00000550358 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.49□□□□□ -1.53
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