RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 C20orf202A1L168 122 aa-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 H0Y9P7 68 aa-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 MT-ATP8P03928 68 aa-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.77□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 ABCA3Q99758 1704 aa-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 H3BQF6 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 I3L3M4 83 aa-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.78□□□□□ -2.53
CCDC82-208ENST00000545264 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 REV3LO60673 3130 aa-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.79□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 GNGT1P63211 74 aa-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 PMCHL1Q16048 86 aa-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 C14orf144Q96I85 54 aa-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 PKD1P98161 4303 aa-0.8□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 NBASA2RRP1 2371 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 NDUFC1O43677 76 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.81□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.82□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 AKAP13Q12802 2813 aa-0.82□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.82□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.83□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.83□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.83□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.83□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM218A2RU14 115 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 MPC2O95563 127 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 UQCRHP07919 91 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 S100PP25815 95 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 S100A10P60903 97 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 CUX1P39880 1505 aa-0.84□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.85□□□□□ -2.54
CCDC82-208ENST00000545264 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 ITPR3Q14573 2671 aa-0.85□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.86□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.86□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.86□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.86□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.86□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.86□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 LYSTQ99698 3801 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 ATOX1O00244 68 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 CCL22O00626 93 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 F8WEM9 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 TRANK1O15050 2925 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 C5P01031 1676 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 CLIP1P30622 1438 aa-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 TACC2O95359 2948 aa-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 HMGN3Q15651 99 aa-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.89□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 D6R8Y8 96 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 LEPROTL1O95214 131 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 RBP2P50120 134 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.9□□□□□ -2.55
CCDC82-208ENST00000545264 ABCC2Q92887 1545 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms