RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 SFTA2Q6UW10 78 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 REG3GQ6UW15 175 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 C2orf82Q6UX34 121 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 LITAFQ99732 161 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 EPM2AB3EWF7 344 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 NDUFA1O15239 70 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TRACP01848 142 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 HERVK_113P63121 156 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TMEM126AQ9H061 195 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 A0A0J9YXV3 536 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TRBV12-3P01733 135 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3-53P01767 116 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 Q6ZQT7 251 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 Q8NBF4 154 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 TMEM101Q96IK0 257 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-216ENST00000537568 C16orf90A8MZG2 172 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 F6UB75 175 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 H7C423 109 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 CXCL5P42830 114 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 DAND5Q8N907 189 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 LINC00643Q86TS7 51 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 COX7A2LO14548 114 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3-11P01762 117 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 JPT2Q9H910 190 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 EMP1P54849 157 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.48□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.48□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 H0YGX0 51 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 INSP01308 110 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 IGLV1-51P01701 117 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 FAM104AQ969W3 186 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-216ENST00000537568 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 A0A0J9YWU9 116 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 A0A1B0GX51 115 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 H7C2G1 150 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 UQCRQO14949 82 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 Q5VSD8 79 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 NACAE9PAV3 2078 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 SYNJ2BPP57105 145 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 DEFB1P60022 68 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 ATOX1O00244 68 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 C5orf38Q86SI9 138 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 H3BQ85 93 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 M0R2N4 97 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 DEFB131AP59861 70 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 LINC01587Q99440 93 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 TNXBP22105 4242 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 CRPP02741 224 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 APLNQ9ULZ1 77 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.4□□□□□ -1.54
LMO3-216ENST00000537568 F5H768 121 aa5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms