RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533768.5

PDE4DIP-232, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-232ENST00000533768 PRSS2P07478 247 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 AMELXQ99217 191 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 TIMM17AQ99595 171 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGKV2D-28P01615 120 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 Q6ZN92 141 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 FA2HQ7L5A8 372 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 ERASQ7Z444 233 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 SPRR4Q96PI1 79 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 VCX2Q9H322 139 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 A0A096LNJ9 63 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 SLC25A20O43772 301 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 LINC00614P0C842 121 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 RAB5BP61020 215 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 Q8IZM0 81 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 TMEM126AQ9H061 195 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 COLCA2A8K830 154 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 F8VRH5 84 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4DIP-232ENST00000533768 TMEM238C9JI98 176 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 SCO1O75880 301 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 TRGC2P03986 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 SEC11AP67812 179 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 HBDP02042 147 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 M0R378 163 aa6□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 HERVK_113P63121 156 aa6□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 PMVKQ15126 192 aa6□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 CST9LQ9H4G1 147 aa6□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 PMCHL1Q16048 86 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 ATP5LO75964 103 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 LCE2BO14633 110 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 CXCL5P42830 114 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 BAGE3Q86Y29 109 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 C9orf92A6NGG3 77 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HSBP1O75506 76 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGLC3P0DOY3 106 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 LINC00310P59036 64 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 SERF1AO75920 110 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 NDUFA6P56556 154 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 H3BRM9 83 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BKO60814 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BJP06899 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 VPREB1P12018 145 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 S100A1P23297 94 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BOP23527 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BBP33778 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BDP58876 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BCP62807 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 LINC00846Q9NV44 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 MOBPQ13875 183 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 LINC00483Q53H64 154 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 C11orf86A6NJI1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 LEPROTL1O95214 131 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 SPINK8P0C7L1 97 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 COX7B2Q8TF08 81 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 ATP6V1G1O75348 118 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 IGLV6-57P01721 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 TMEM223A0PJW6 202 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4DIP-232ENST00000533768 Q6Q795 121 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms