RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 COX17Q14061 63 aa5.22□□□□□ -1.57
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.22□□□□□ -1.57
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SFTA2Q6UW10 78 aa5.22□□□□□ -1.57
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BAGE3Q86Y29 109 aa5.22□□□□□ -1.57
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ERG28Q9UKR5 140 aa5.22□□□□□ -1.57
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CRYGAP11844 174 aa5.21□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PMCHL1Q16048 86 aa5.21□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRR4Q16378 134 aa5.21□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SVBPQ8N300 66 aa5.21□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.21□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.2□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKV2D-28P01615 120 aa5.2□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.2□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.2□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TNXBP22105 4242 aa5.2□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C11orf86A6NJI1 115 aa5.19□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A087X002 238 aa5.18□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SCO1O75880 301 aa5.18□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TSPAN13O95857 204 aa5.18□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 VPREB1P12018 145 aa5.18□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LCE4AQ5TA78 99 aa5.18□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LRP2P98164 4655 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ATP6V1G1O75348 118 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00158P58513 81 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM126AQ9H061 195 aa5.17□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.16□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.16□□□□□ -1.58
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.15□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM223A0PJW6 202 aa5.15□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM238C9JI98 176 aa5.15□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HSBP1O75506 76 aa5.15□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRLHP81277 87 aa5.15□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.15□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A0U1RRA0 63 aa5.14□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00587B1AMM8 73 aa5.14□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HERV-K104P63124 156 aa5.14□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.14□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.14□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 M0R378 163 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 YPEL4Q96NS1 127 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.13□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H0Y8G0 127 aa5.12□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SMIM13P0DJ93 91 aa5.12□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.12□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.12□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q8NDZ9 215 aa5.12□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.12□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LEPROTL1O95214 131 aa5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CTAG1AP78358 180 aa5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 S100A12P80511 92 aa5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRYO14603 147 aa5.1□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NCR3O14931 201 aa5.1□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRGC2P03986 189 aa5.1□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PLNP26678 52 aa5.1□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.1□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.09□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SERF1AO75920 110 aa5.09□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.09□□□□□ -1.59
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A0U1RQV1 116 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LEPROTO15243 131 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HERVK_113P61574 105 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPRR4Q96PI1 79 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LPAP08519 4548 aa5.08□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RNF213Q63HN8 5207 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DPM2O94777 84 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FABP4P15090 132 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.07□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 J3QQQ9 107 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPRR1AP35321 89 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NMUP48645 174 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CDIP1Q9H305 208 aa5.06□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKCP01834 107 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DDTP30046 118 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TPRXLQ17RH7 258 aa5.05□□□□□ -1.6
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms