RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 XCL2Q9UBD3 114 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 AKAP6Q13023 2319 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 AKAP9Q99996 3911 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 A0A0U1RRA0 63 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 NDUFC2O95298 119 aa2.64□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 SS18Q15532 418 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.64□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.64□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.63□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 IGLV1-51P01701 117 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 MUC7Q8TAX7 377 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 UPK3BQ9BT76 320 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 C16orf95Q9H693 158 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 NBASA2RRP1 2371 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.62□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 J3KT08 172 aa2.62□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 CCKP06307 115 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 LINC00158P58513 81 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 TMEM258P61165 79 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 SERP2Q8N6R1 65 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 LINC00846Q9NV44 126 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.62□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 CR1P17927 2039 aa2.62□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 ZFHX3Q15911 3703 aa2.62□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.61□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.61□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 KIAA0087Q14695 138 aa2.61□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 VPS13CQ709C8 3753 aa2.61□□□□□ -1.99
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SGCE-211ENST00000522045 H3BQ85 93 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 NCR3O14931 201 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 PRB1P04280 392 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 Q8N814 137 aa2.6□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 PFN2P35080 140 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 C6orf223Q8N319 242 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 C3orf56Q8N813 242 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 PRO0255Q9UI72 69 aa2.59□□□□□ -1.99
SGCE-211ENST00000522045 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CREBBPQ92793 2442 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 NCOR2Q9Y618 2525 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 A0A087WVE0 104 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.58□□□□□ -2
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SGCE-211ENST00000522045 XCL1P47992 114 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 LINC00575Q6W349 94 aa2.58□□□□□ -2
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SGCE-211ENST00000522045 Q8NDZ9 215 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 PKD1L2Q7Z442 2459 aa2.58□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 PDE6GP18545 87 aa2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 SPAG11BQ08648 103 aa2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 C6orf99Q4VX62 202 aa2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 UBL5Q9BZL1 73 aa2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 FBN2P35556 2912 aa2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 SORL1Q92673 2214 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1AO00555 2505 aa2.56□□□□□ -2
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