RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABCC5O15440 1437 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCL22O00626 93 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLIT1O75093 1534 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 KNDC1Q76NI1 1749 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 SONP18583 2426 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASIPP42127 132 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABCA3Q99758 1704 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 MLH3Q9UHC1 1453 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 RYR2Q92736 4967 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 C20orf202A1L168 122 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 MPC2O95563 127 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNGT2O14610 69 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ITPR3Q14573 2671 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 H7BZZ5 65 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 UQCRHP07919 91 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRGV9Q99603 122 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLIP1P30622 1438 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPTBN4Q9H254 2564 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABCC2Q92887 1545 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF213Q63HN8 5207 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 REV3LO60673 3130 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.73□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 CUX1P39880 1505 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBASA2RRP1 2371 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 AKAP13Q12802 2813 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 H0YGG7 62 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 HMGN3Q15651 99 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 LELP1Q5T871 98 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 C5P01031 1676 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATOX1O00244 68 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRANK1O15050 2925 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM218A2RU14 115 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 PKD1P98161 4303 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 TACC2O95359 2948 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT-ATP8P03928 68 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 D6R8Y8 96 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGLC3P0DOY3 106 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 ETDBQ3ZM63 59 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 NMSQ5H8A3 153 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 S100PP25815 95 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 LEPROTL1O95214 131 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00032P0C843 101 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 HTTP42858 3142 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 S100A10P60903 97 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-1.88□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms