RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 MAPKBP1O60336 1514 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 CFTRP13569 1480 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 MBD5Q9P267 1494 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 SCGB1A1P11684 91 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 PDCD10Q9BUL8 212 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 PP6455Q8WZ26 134 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 LRBAP50851 2863 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM223BA6NKX1 122 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPANXDQ9BXN6 97 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANKRD36A6QL64 1941 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A0G2JND7 137 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 CEP152O94986 1710 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A087WVE0 104 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 H3BQF6 201 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 COX6CP09669 75 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 COPZ1P61923 177 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 Q56UQ5 140 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 DPH3Q96FX2 82 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 SERP1Q9Y6X1 66 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 SELENOSQ9BQE4 189 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 SHROOM2Q13796 1616 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 FABP1P07148 127 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 GNGT1P63211 74 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 RERGLQ9H628 205 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 BPTFQ12830 3046 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 MRC2Q9UBG0 1479 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARMS2P0C7Q2 107 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRLHP81277 87 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 CDC26Q8NHZ8 85 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 C4AP0C0L4 1744 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 C4BP0C0L5 1744 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 H0Y9P7 68 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 C12orf57Q99622 126 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 ABCC5O15440 1437 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 CUX1P39880 1505 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 TSTD1Q8NFU3 115 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 MANBALQ9NQG1 85 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-561P-201ENST00000516222 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-2.97□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 F6UZH7 168 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMIM21Q3B7S5 101 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 PREX1Q8TCU6 1659 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 NBEAP1P0C6P0 100 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 VAMP8Q9BV40 100 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 LINC00474Q9P2X8 69 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 GRIN2AQ12879 1464 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 TOP2BQ02880 1626 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 MT1EP04732 61 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 CKS1BP61024 79 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 GNG11P61952 73 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 Q0VG73 95 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 PFDN5Q99471 154 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRO1854Q9UHT4 67 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 NDUFA3O95167 84 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 KIF20BQ96Q89 1820 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 AP4S1Q9Y587 144 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 PHLPP1O60346 1717 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 CATR1Q13166 79 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 SHPRHQ149N8 1683 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 C7orf77A4D0Y5 90 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 APOC2P02655 101 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 RGPD5Q99666 1765 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 PSMG4Q5JS54 123 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 LZICQ8WZA0 190 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 MT1LQ93083 61 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 NAP1L6A6NFF2 107 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 HSD52Q0P140 79 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 MON2Q7Z3U7 1717 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARPC4P59998 168 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-561P-201ENST00000516222 DR1Q01658 176 aa-3.09□□□□□ -2.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.3 ms