RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514889.1

RASGEF1B-212, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 648 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-212ENST00000514889 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.35□□□□□ -1.39
RASGEF1B-212ENST00000514889 C11orf86A6NJI1 115 aa6.34□□□□□ -1.39
RASGEF1B-212ENST00000514889 M0QXV9 152 aa6.34□□□□□ -1.39
RASGEF1B-212ENST00000514889 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.34□□□□□ -1.39
RASGEF1B-212ENST00000514889 TRGC2P03986 189 aa6.33□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 CXCL5P42830 114 aa6.33□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 RAB5BP61020 215 aa6.33□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 C1orf137Q5JT78 98 aa6.33□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 LINC01600Q96MT4 127 aa6.33□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 ATP5LO75964 103 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 BAGE3Q86Y29 109 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 COLCA2A8K830 154 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 IGLV7-43P04211 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 C22orf24Q9Y442 160 aa6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 H3BRM9 83 aa6.3□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 NUPR1O60356 82 aa6.3□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 KRTAP10-8P60410 259 aa6.3□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.3□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 UBE2BP63146 152 aa6.29□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.28□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.28□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 HSBP1O75506 76 aa6.28□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 SCO1O75880 301 aa6.28□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 SERF1AO75920 110 aa6.28□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.28□□□□□ -1.4
RASGEF1B-212ENST00000514889 TMEM223A0PJW6 202 aa6.27□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 REG3GQ6UW15 175 aa6.27□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 Q8NDZ9 215 aa6.27□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 H0Y9J4 135 aa6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 PFN2P35080 140 aa6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 LINC00167Q96N53 147 aa6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 ERG28Q9UKR5 140 aa6.26□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.25□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.24□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 H0Y8G0 127 aa6.24□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 DIRC1Q969H9 104 aa6.24□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.24□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.24□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 LEPROTL1O95214 131 aa6.23□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 VPREB1P12018 145 aa6.23□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.23□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 FABP4P15090 132 aa6.22□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.22□□□□□ -1.41
RASGEF1B-212ENST00000514889 A0A0U1RRA0 63 aa6.21□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF861PO60384 105 aa6.21□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 LRP2P98164 4655 aa6.21□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 COX17Q14061 63 aa6.21□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 BCE1O60756 84 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BKO60814 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 IGKV2D-28P01615 120 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BJP06899 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BOP23527 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BBP33778 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BDP58876 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BCP62807 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 SMIM13P0DJ93 91 aa6.19□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 LINC00158P58513 81 aa6.19□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 SFTA2Q6UW10 78 aa6.19□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.19□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.18□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.18□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.18□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 TMEM238C9JI98 176 aa6.17□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 M0R378 163 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 LEPROTO15243 131 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 DPM2O94777 84 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 IGKCP01834 107 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 PLNP26678 52 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 TMEM126AQ9H061 195 aa6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 A0A087X002 238 aa6.15□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 HERV-K104P63124 156 aa6.15□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 PRLHP81277 87 aa6.15□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.15□□□□□ -1.42
RASGEF1B-212ENST00000514889 LPAP08519 4548 aa6.15□□□□□ -1.43
RASGEF1B-212ENST00000514889 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.14□□□□□ -1.43
RASGEF1B-212ENST00000514889 J3QQQ9 107 aa6.14□□□□□ -1.43
RASGEF1B-212ENST00000514889 UBE2AP49459 152 aa6.14□□□□□ -1.43
RASGEF1B-212ENST00000514889 DAND5Q8N907 189 aa6.14□□□□□ -1.43
RASGEF1B-212ENST00000514889 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.14□□□□□ -1.43
RASGEF1B-212ENST00000514889 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms