RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0J9YX75	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8TAT8	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	FCER1G	P30273	86 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	AGRN	O00468	2067 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GUT8	65 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	PLN	P26678	52 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N814	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CFC1	P0CG37	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZRP5	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB131A	P59861	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	PRR9	Q5T870	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		H7C423	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	SPINK4	O60575	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAL4	O96015	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB1	P60022	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0J9YXY3	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	CRP	P02741	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	MTOR	P42345	2549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R17	O96001	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971		Q5VV11	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971		U3KQK5	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971		D6R8Y8	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	BPY2	O14599	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	ROMO1	P60602	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	F8	P00451	2351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971		A6NED7	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	INS	P01308	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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