RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf25Q5T742 122 aa5.86□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.86□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.86□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 H3BUX3 64 aa5.86□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.86□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.86□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 BCE1O60756 84 aa5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 USMG5Q96IX5 58 aa5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 CELA1Q9UNI1 258 aa5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFC1O43677 76 aa5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV1-40P01703 118 aa5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.84□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 hDV103S1A0JD37 113 aa5.84□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB136Q30KP8 78 aa5.84□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00575Q6W349 94 aa5.84□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.84□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 OCR1Q9BZK8 76 aa5.84□□□□□ -1.47
VWA3B-220ENST00000495571 K7EMT4 169 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZQY7 126 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2L6O14933 153 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 CXCL6P80162 114 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 MUC7Q8TAX7 377 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM89A2RUT3 159 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 A8MUN3 132 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.83□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 ESM1Q9NQ30 184 aa5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV4-1P06312 121 aa5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP10-9P60411 292 aa5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 CD164Q04900 197 aa5.82□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.81□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 ITPR2Q14571 2701 aa5.81□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.81□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.8□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.8□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.8□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.8□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 KLK12Q9UKR0 248 aa5.8□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 SLURP1P55000 103 aa5.79□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.79□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 Q1T7F1 81 aa5.79□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV4-59P01825 116 aa5.78□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 SYCNQ0VAF6 134 aa5.78□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.78□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 A6NDX4 124 aa5.78□□□□□ -1.48
VWA3B-220ENST00000495571 C3orf84H3BNL1 204 aa5.77□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM29Q86T20 159 aa5.77□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.77□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 ITPR3Q14573 2671 aa5.77□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.76□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 H3BUA1 57 aa5.76□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.76□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.76□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.76□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 HIVEP2P31629 2446 aa5.76□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 A0A096LPF7 62 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 C16orf90A8MZG2 172 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 Q5VV11 94 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 ERC2-IT1O76042 136 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 KIAA0087Q14695 138 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.75□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 PDZD2O15018 2839 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 MSMBP08118 114 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.74□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.73□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 B4DSR2 109 aa5.73□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 INSP01308 110 aa5.73□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 PSCAO43653 123 aa5.73□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.72□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 M0R378 163 aa5.71□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 LCA10Q71F78 164 aa5.71□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 Q8IZM0 81 aa5.71□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.71□□□□□ -1.49
VWA3B-220ENST00000495571 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.71□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.71□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.7□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.7□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.7□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.69□□□□□ -1.5
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV6-57P01721 117 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms