RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495510.1

SPART-211, Transcript of spartin, humanhuman

TSL 2

Gene SPART, Length 2,001 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPART-211ENST00000495510 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SPART-211ENST00000495510 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.59□□□□□ -1.19
SPART-211ENST00000495510 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.59□□□□□ -1.19
SPART-211ENST00000495510 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.59□□□□□ -1.19
SPART-211ENST00000495510 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.59□□□□□ -1.19
SPART-211ENST00000495510 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.59□□□□□ -1.19
SPART-211ENST00000495510 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.58□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 S100PP25815 95 aa7.57□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 SPINK1P00995 79 aa7.57□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 Q8NDZ9 215 aa7.57□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 PRYO14603 147 aa7.56□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 UQCC3Q6UW78 93 aa7.56□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 SPRR1AP35321 89 aa7.54□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 A0A096LNJ9 63 aa7.54□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 NDUFA6P56556 154 aa7.54□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 CLLU1Q5K131 121 aa7.54□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 Q8NBF4 154 aa7.54□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.53□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 LINC00483Q53H64 154 aa7.53□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 TMEM218A2RU14 115 aa7.52□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 C11orf86A6NJI1 115 aa7.52□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 HBDP02042 147 aa7.52□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 LINC00158P58513 81 aa7.52□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.52□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
SPART-211ENST00000495510 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.52□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 SEC11CQ9BY50 192 aa7.52□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.52□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.51□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 LINC00614P0C842 121 aa7.51□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.51□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.51□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.51□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 BAGE3Q86Y29 109 aa7.5□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 DAND5Q8N907 189 aa7.49□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.49□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 LINC00587B1AMM8 73 aa7.49□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.48□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.48□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 TMEM223A0PJW6 202 aa7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 HERV-K104P63124 156 aa7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 S100A12P80511 92 aa7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 SLC25A20O43772 301 aa7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SPART-211ENST00000495510 S100A1P23297 94 aa7.46□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 XP32Q5T750 250 aa7.46□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 Q8N377 158 aa7.46□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.45□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 SMIM13P0DJ93 91 aa7.45□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 RHEBQ15382 184 aa7.45□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.44□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 B5MCH6 92 aa7.44□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.44□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.44□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.44□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.44□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.43□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 A0A0U1RRA0 63 aa7.43□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.43□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 NCR3O14931 201 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 PMCHL1Q16048 86 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 S100A6P06703 90 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 MOBPQ13875 183 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.42□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.4□□□□□ -1.22
SPART-211ENST00000495510 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.4□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.4□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.39□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 C5orf52A6NGY3 159 aa7.39□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 ERC2-IT1O76042 136 aa7.39□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 LCE2CQ5TA81 110 aa7.39□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 Q6ZRX8 168 aa7.39□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 DDTP30046 118 aa7.38□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.38□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 IFITM2Q01629 132 aa7.37□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 Q9BRP9 147 aa7.37□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 NDUFA5Q16718 116 aa7.36□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.35□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 A6NJY4 79 aa7.35□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 NDUFC2O95298 119 aa7.35□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 CFC1BP0CG36 223 aa7.35□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 IGLV6-57P01721 117 aa7.34□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 COMMD7Q86VX2 200 aa7.34□□□□□ -1.23
SPART-211ENST00000495510 LEPROTO15243 131 aa7.34□□□□□ -1.24
SPART-211ENST00000495510 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.34□□□□□ -1.24
SPART-211ENST00000495510 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.34□□□□□ -1.24
SPART-211ENST00000495510 NMUP48645 174 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms