RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.45□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.45□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 ERG28Q9UKR5 140 aa7.45□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.43□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 IGKV2D-28P01615 120 aa7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 VPREB1P12018 145 aa7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.41□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 Q8NDZ9 215 aa7.41□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 TMEM223A0PJW6 202 aa7.4□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 COX17Q14061 63 aa7.4□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.4□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.4□□□□□ -1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 HSBP1O75506 76 aa7.39□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 SFTA2Q6UW10 78 aa7.39□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 A0A087X002 238 aa7.38□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 TRGC2P03986 189 aa7.38□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 UBE2AP49459 152 aa7.38□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 TMEM238C9JI98 176 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 LINC00310P59036 64 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 A0A0U1RRA0 63 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 LINC00158P58513 81 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 S100A12P80511 92 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 PRLHP81277 87 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 TMEM126AQ9H061 195 aa7.37□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 H0Y8G0 127 aa7.36□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 SERF1AO75920 110 aa7.36□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.36□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.36□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.35□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 M0R378 163 aa7.34□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 SMIM13P0DJ93 91 aa7.34□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 CRYGAP11844 174 aa7.34□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.34□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 RNF213Q63HN8 5207 aa7.34□□□□□ -1.23
SUCLG2-204ENST00000493112 LEPROTL1O95214 131 aa7.33□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 LPAP08519 4548 aa7.33□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.32□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.32□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.32□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 TSPAN13O95857 204 aa7.32□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.32□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.32□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 COLCA2A8K830 154 aa7.31□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 PRR4Q16378 134 aa7.31□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.31□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 NCR3O14931 201 aa7.3□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 FABP4P15090 132 aa7.3□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 HERV-K104P63124 156 aa7.3□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.3□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.3□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.3□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 PLNP26678 52 aa7.29□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.28□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 LEPROTO15243 131 aa7.28□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.28□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.28□□□□□ -1.24
SUCLG2-204ENST00000493112 DPM2O94777 84 aa7.27□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 DAND5Q8N907 189 aa7.27□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.27□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 LINC00587B1AMM8 73 aa7.26□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 J3QQQ9 107 aa7.26□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 PRYO14603 147 aa7.26□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.26□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.25□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 IGKCP01834 107 aa7.25□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HERVK_113P61574 105 aa7.25□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.25□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.24□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 SPRR1AP35321 89 aa7.23□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.23□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 SPRR4Q96PI1 79 aa7.23□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.23□□□□□ -1.25
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SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BJP06899 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BOP23527 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BBP33778 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 NMUP48645 174 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BDP58876 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BCP62807 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.22□□□□□ -1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.21□□□□□ -1.26
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