RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487530.2

LYST-210, Transcript of lysosomal trafficking regulator, humanhuman

TSL 4

Gene LYST, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LYST-210ENST00000487530 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
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