RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485556.5

STRC-211, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 4,253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-211ENST00000485556 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.92□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 MP68P56378 58 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 C4orf26Q17RF5 130 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 Q8N3U1 123 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 Q8N814 137 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 A8MTW9 85 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 Q8NAQ8 132 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 ATMQ13315 3056 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 CCDC179H3BU77 68 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.91□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.9□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.9□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.9□□□□□ -1.3
STRC-211ENST00000485556 C2orf48Q96LS8 159 aa6.9□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.89□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 C20orf197Q8N268 126 aa6.89□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.89□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.88□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 COL6A5A8TX70 2615 aa6.88□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.88□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.88□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 C7orf33Q8WU49 177 aa6.88□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.87□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.87□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.87□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.86□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 COL12A1Q99715 3063 aa6.86□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 KRTAP10-3P60369 221 aa6.86□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 C10orf25Q5T742 122 aa6.86□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.85□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 NOTCH1P46531 2555 aa6.85□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 IMUPQ9GZP8 106 aa6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 UQCRQO14949 82 aa6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 H3BNG1 76 aa6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 PMAIP1Q13794 54 aa6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRC-211ENST00000485556 REV3LO60673 3130 aa6.84□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 H3BS24 57 aa6.84□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 REG3GQ6UW15 175 aa6.84□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.83□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 LINC00575Q6W349 94 aa6.83□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.83□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 C1orf137Q5JT78 98 aa6.82□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 TMEM258P61165 79 aa6.81□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 TACC2O95359 2948 aa6.81□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 Q6JHZ5 121 aa6.81□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.81□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 A0A087WVE0 104 aa6.8□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.8□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 MDFIQ99750 246 aa6.8□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 IGKV4-1P06312 121 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 C22orf24Q9Y442 160 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 ZZEF1O43149 2961 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 PRLHP81277 87 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 LITAFQ99732 161 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 SERP2Q8N6R1 65 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 PRYO14603 147 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.79□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 KALRNO60229 2985 aa6.78□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 KRTAP10-11P60412 298 aa6.78□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 CD164Q04900 197 aa6.78□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 PRO0461Q9UI25 63 aa6.78□□□□□ -1.32
STRC-211ENST00000485556 ZNF575Q86XF7 245 aa6.77□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 LINC00846Q9NV44 126 aa6.77□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 Q6Q795 121 aa6.76□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.76□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 CR1P17927 2039 aa6.76□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 LINC00167Q96N53 147 aa6.75□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 SNURFQ9Y675 71 aa6.75□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.75□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 COX7CP15954 63 aa6.75□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 Q9BRP9 147 aa6.75□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 CDIP1Q9H305 208 aa6.75□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 K7EIL1 84 aa6.74□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 ITPR1Q14643 2758 aa6.74□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.74□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.74□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 A0A087WSZ3 146 aa6.73□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.73□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.73□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 Q6ZVQ6 151 aa6.73□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.72□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms